華為云CCI全方位支撐基因檢測核心技術(shù)
中國每年有1400萬新生兒、300萬新發(fā)腫瘤患者。意味著每5個(gè)家庭迎來新添成員的喜悅,就有一個(gè)家庭陷入可能失去親人的悲痛。每一天,都有8000+人失去健康。
如果可以早知道、早預(yù)防、早治療; 如果我們有一份報(bào)告,告訴我們可能在自己身上發(fā)生的病變;如果我們可以趕在時(shí)間前面、趕在疾病前面。。。。這聽起來是不是有點(diǎn)科幻?
2017年,我國發(fā)改委明確了基因檢測能力覆蓋50%以上出生人口的目標(biāo),利用基因測序等高科技手段,在胎兒罕見病篩查、腫瘤、遺傳性疾病等方面實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的預(yù)防和診治。通過對血液、體液、細(xì)胞或DNA通過基因測序等技術(shù)手段進(jìn)行檢測,分析是否含有潛在高風(fēng)險(xiǎn)疾病可能性,以及表達(dá)功能是否正常。
更多的疾病將依賴基因檢測結(jié)果作為主要信息作出診療判斷,基因檢測技術(shù)也為精準(zhǔn)治療藥物的創(chuàng)新開發(fā),減少無效和過度醫(yī)療、避免有害醫(yī)療、遏制醫(yī)療費(fèi)用過度支出等提供大數(shù)據(jù)平臺(tái)支撐。
在基因檢測技術(shù)中,工具碎片化、開發(fā)語言多樣、系統(tǒng)維護(hù)和升級等技術(shù)難題一直在制約行業(yè)的快速發(fā)展。容器技術(shù)因?yàn)闃?biāo)準(zhǔn)化封裝保證環(huán)境一致性、秒級擴(kuò)縮容、高資源利用率的特點(diǎn)逐漸作為支撐基因檢測的核心技術(shù)。
在這一場推動(dòng)人類繁榮發(fā)展的浪潮中,上海其明信息技術(shù)有限公司就是其中之一,通過先進(jìn)的云計(jì)算技術(shù)為醫(yī)療用戶提供更高效診斷,更科學(xué)化的建議,所開發(fā)的基因檢測與基因云計(jì)算的GCBI綜合平臺(tái)被廣大醫(yī)療及科研院所接受。華為云容器實(shí)例(Cloud Container Instance)服務(wù)(以下簡稱華為云CCI),以高安全、高性能、低成本、簡單易用的優(yōu)點(diǎn)作為GCBI的底層核心技術(shù)支撐,幫助GCBI平臺(tái)服務(wù)于基因檢測行業(yè)。
基因檢測挑戰(zhàn)諸多 華為云CCI多方位承載GCBI核心業(yè)務(wù)
華為云CCI在2018年3月推出公測,也是全球***基于K8S的商用serverless容器服務(wù),在多方面滿足了其明公司的需要:
華為云CCI目前采用Kata安全容器技術(shù),將虛擬機(jī)成熟的隔離技術(shù)應(yīng)用到容器領(lǐng)域,確??蛻魳I(yè)務(wù)和數(shù)據(jù)的安全。
1. 按需按秒計(jì)費(fèi)很有必要,節(jié)省成本可達(dá)50%
基因測序公司在承接用戶業(yè)務(wù)時(shí),通常是在樣品累積夠一定量的時(shí)候進(jìn)行批量處理,這就意味著原始數(shù)據(jù)來源具有周期性,業(yè)務(wù)波動(dòng)性較大。為了保證對醫(yī)療及科研客戶的交付,其明公司通常是按照***的業(yè)務(wù)量來維護(hù)虛機(jī)規(guī)模,但是這些資源在相當(dāng)一段時(shí)間內(nèi)處于閑置狀態(tài),造成極大的浪費(fèi)。
華為云CCI按需按秒計(jì)費(fèi)的功能妥善的解決了這一難題,解決了其明公司業(yè)務(wù)波動(dòng)性帶來的資源浪費(fèi)以及成本難問題。經(jīng)過上海其明公司信息技術(shù)有限公司仔細(xì)測算,按需按秒計(jì)費(fèi)比包年包月節(jié)省成本高達(dá)50%。
2. 從20分鐘提升為秒級并發(fā),華為云CCI功不可沒
在基因測序的市場中,幾乎所有的公司都會(huì)面臨這樣的問題:基因測序以及測序結(jié)果的解析需要較長時(shí)間,用戶無法實(shí)時(shí)拿到實(shí)驗(yàn)結(jié)果,便會(huì)產(chǎn)生不信任的心理,會(huì)對新事物產(chǎn)生質(zhì)疑
其明公司也不例外,每個(gè)樣品需要8核至32核容器實(shí)例進(jìn)行計(jì)算,后臺(tái)需要高并發(fā)的計(jì)算量在兩小時(shí)內(nèi)反饋結(jié)果,以保證其對客戶的SLA。然而每次啟動(dòng)虛機(jī),集群和節(jié)點(diǎn)納管、業(yè)務(wù)上線時(shí)間就需要近20分鐘,即使是業(yè)務(wù)擴(kuò)容,也需要耗費(fèi)10多分鐘。
華為云CCI秒級伸縮和高并發(fā)的特性針對這一問題做出了極大改善,kata容器啟動(dòng)速度實(shí)測600毫秒,集群規(guī)模高達(dá)上十萬容器實(shí)例,其明公司GCBI平臺(tái)在使用華為云CCI服務(wù)后,業(yè)務(wù)上線時(shí)間從20分鐘降為秒級并發(fā),大大提升效率,不會(huì)再為滿足客戶SLA感到擔(dān)心。
3. 運(yùn)維簡化后,省心省力省錢,只需專注業(yè)務(wù)。
在使用華為云CCI之前,其明公司在自己的公有云虛機(jī)資源內(nèi)納管了一個(gè)小型的K8S集群,并積累了大量的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn),即便如此,對硬件資源和K8S集群的運(yùn)維依然是件頭疼的事,需要考慮集群的升級、社區(qū)bug修復(fù)、集群資源利用率等問題,消耗著公司大量資源。
華為云CCI將serverless理念引入到容器領(lǐng)域,可以直接購買和管理容器實(shí)例,無需管理物理資源和K8S集群,同時(shí),華為云CCI提供了可視化的pod CPU/MEM監(jiān)控功能,可以實(shí)時(shí)監(jiān)控處理過程,極大的簡化運(yùn)維成本,讓上海其明公司信息技術(shù)有限公司可以專注自己的業(yè)務(wù)。
其明公司開發(fā)總監(jiān)蔡家華表示:“通過將自己的業(yè)務(wù)部署在華為云CCI上,實(shí)際計(jì)算成本降低30%-50%,并且實(shí)現(xiàn)了K8S和物理資源免運(yùn)維。其明公司非常高興華為云CCI可以幫助自己實(shí)現(xiàn)一系列成本的降低,提升客戶SLA的服務(wù)標(biāo)準(zhǔn),讓自己可以更聚焦業(yè)務(wù)和客戶。”
有華為云助力,其明公司基因檢測與基因云計(jì)算的綜合平臺(tái)GCBI已完成25萬例基因數(shù)據(jù)分析和挖掘、協(xié)助作出1萬多次基于基因信息的臨床決策,參與8萬余個(gè)疾病相關(guān)基因臨床信息挖掘研究項(xiàng)目。
人工智能也好,基因檢測也罷,好的技術(shù)應(yīng)該用來幫助更多的人。將至已至,未來已來,3月21日,華為中國生態(tài)伙伴大會(huì),我們并肩同行,福州見。