Fo-dicom開源庫是如何滿足DICOM標準的基本要求
DICOM基本概念
DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是數(shù)字醫(yī)學圖像和通信的國際標準,用于描述、傳輸、存儲、檢索、打印和顯示醫(yī)學圖像以及相關的文本和數(shù)據信息。DICOM標準最初由美國國家電氣制造商協(xié)會(NEMA)和醫(yī)療設備制造商協(xié)會(MITA)共同開發(fā),現(xiàn)在已經成為全球醫(yī)學圖像處理和管理的標準。
DICOM標準定義了醫(yī)學圖像和數(shù)據在不同設備和系統(tǒng)之間的無縫交互性,這意味著可以在不同廠商的設備上進行圖像傳輸和共享,同時確保圖像和相關信息的完整性和準確性。#dicom#標準支持各種模態(tài)的醫(yī)學圖像,包括CT、MRI、X射線、超聲、核醫(yī)學等。
DICOM標準包括文件格式、數(shù)據元素、服務類、網絡協(xié)議等多個方面,可以通過各種編程語言和軟件庫進行實現(xiàn)和應用。常見的DICOM軟件庫包括fo-dicom、dcmtk、GDCM、dcm4che,pydicom等。
截至目前(2023年12月),DICOM的最新版本是DICOM 3.0。DICOM標準在發(fā)布后經過不斷更新和修訂,以適應醫(yī)學圖像和通信技術的發(fā)展,并增加新的功能和改進現(xiàn)有功能。因此,DICOM的版本可能隨著時間的推移而變化。
fo-dicom是如何滿足 DICOM標準的基本要求
fo-dicom 是一個符合 DICOM 標準的 C# 實現(xiàn)庫。它滿足 DICOM 標準的基本要求,包括以下方面:
- 支持 DICOM 數(shù)據格式:fo-dicom 支持讀取、解析和生成 DICOM 數(shù)據格式,可以輕松地處理各種類型的 DICOM 文件和數(shù)據流。
- 實現(xiàn) DICOM 網絡通信:fo-dicom 實現(xiàn)了 DICOM 網絡通信協(xié)議,支持與遠程 DICOM 設備進行通信,如查詢、檢索、存儲和發(fā)送等操作。
- 解析 DICOM 元數(shù)據:fo-dicom 可以解析 DICOM 數(shù)據集中的元數(shù)據信息,包括標識符、序列、屬性值、VR(值表示)和長度等。
- 處理 DICOM 圖像數(shù)據:fo-dicom 可以處理 DICOM 圖像數(shù)據,包括加載、顯示和處理像素數(shù)據數(shù)組,支持多種顏色空間和位深度。
- 支持 DICOM 安全:fo-dicom 支持 DICOM 安全機制,包括 TLS 加密和認證等功能,確保通信的安全性和可靠性。
在真正開發(fā)之前,我們先理解幾個fo-dicom構建的基本概念
1、DicomElement(DICOM元素):
在 fo-dicom 中,DicomElement(DICOM 元素)是用于表示 DICOM 數(shù)據集中的單個元素的類。每個 DICOM 元素由一個標簽(Tag)、一個值(Value)和其他屬性組成。
標簽(Tag):DICOM 標簽是一個由兩個 16 位數(shù)字組成的唯一標識符,用于標識 DICOM 數(shù)據集中的每個元素。標簽以 “XXXX,XXXX” 的格式表示,其中 “XXXX” 是一個 16 位的十六進制數(shù)。標簽可以表示數(shù)據的各種屬性,例如像素值、圖像位置、患者信息等。
例如,Tag.SOPClassUID 是一個表示 SOP 類的標簽。它的值是 0008,0016,表示每個 DICOM 數(shù)據集都必須包含該標簽,用于指定數(shù)據集中的 SOP 類別。
值(Value):DicomElement 類中的 Value 屬性存儲了 DICOM 元素的值。這個值可以是一個單一的值,也可以是一個多值的序列。對于多值序列,可以使用 DicomSequence 類來表示序列中的每個元素。
例如,對于某個 DICOM 元素的值是字符串類型,可以通過 DicomElement.GetString() 方法獲取字符串值。
VR(Value Representation,值的表示方式):VR 屬性表示 DICOM 元素值的數(shù)據類型。
例如,DicomVR.PN 表示人名(Person Name)的值表示方式。
VM(Value Multiplicity,值的多重性):VM 屬性表示 DICOM 元素值的允許數(shù)量。
例如,DicomVR.PN 的 VM 屬性為 1,表示人名(Person Name)的值只允許有一個。
Length(值的長度):Length 屬性表示 DICOM 元素值的字節(jié)長度。
例如:假設有一個 DICOM 數(shù)據集中的元素為患者姓名,標簽為 0010,0010,值為 “John Doe”。在 fo-dicom 中,可以通過以下方式創(chuàng)建和訪問該元素:
DicomElement element = new DicomElement(DicomTag.PatientName, "John Doe");
string tag = element.Tag.ToString(); // "0010,0010"
string value = element.GetString(); // "John Doe"
DicomVR vr = element.ValueRepresentation; // DicomVR.PN
int vm = element.ValueMultiplicity; // 1
int length = element.Length; // 8
通過 DicomElement,我們可以方便地訪問和操作 DICOM 數(shù)據集中的每個元素的標簽、值和其他屬性。
2、DicomDataset(DICOM數(shù)據集):
在 fo-dicom 中,DicomDataset(DICOM 數(shù)據集)是用于表示一個完整的 DICOM 數(shù)據集的類。DICOM 數(shù)據集由多個 DICOM 元素(DicomElement)組成,每個元素都有一個唯一的標簽(Tag)和對應的值(Value)。DicomDataset 提供了對 DICOM 數(shù)據集進行處理、讀取和寫入的功能。
DicomDataset 類具有以下特點和功能:
- 存儲 DICOM 元素:DicomDataset 可以容納多個 DICOM 元素。通過添加、刪除和修改元素,可以對 DICOM 數(shù)據集進行操作。
- 獲取和設置元素:可以通過標簽獲取和設置 DICOM 數(shù)據集中的元素??梢允褂?DicomTag 或字符串表示的標簽來訪問元素。
- 保存和加載 DICOM 數(shù)據:DicomDataset 支持將 DICOM 數(shù)據保存到文件中或從文件加載 DICOM 數(shù)據??梢允褂?DicomFile 類來進行文件的讀取和寫入。
例如:假設有一個包含患者姓名和患者 ID 的 DICOM 數(shù)據集。我們可以使用 DicomDataset 類來創(chuàng)建和訪問這些元素:
DicomDataset dataset = new DicomDataset();
// 添加元素
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientName, "John Doe"));
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientID, "12345"));
// 獲取元素值
string patientName = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientName);
string patientID = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientID);
// 修改元素值
dataset.AddOrUpdate(DicomTag.PatientName, "Jane Smith");
// 刪除元素
dataset.Remove(DicomTag.PatientID);
通過使用 DicomDataset,我們可以方便地創(chuàng)建、訪問和操作 DICOM 數(shù)據集中的元素。這樣的功能使得在 fo-dicom 中進行 DICOM 數(shù)據處理變得更加簡單和高效。
3、DicomFile(DICOM文件):
在 fo-dicom 中,DicomFile(DICOM 文件)是用于表示一個 DICOM 文件的類。DICOM 文件通常以 .dcm 或 .dicom 的擴展名保存,其中包含一個完整的 DICOM 數(shù)據集。DicomFile 類提供了讀取和寫入 DICOM 文件的功能。
DicomFile 類具有以下特點和功能:
- 存儲 DICOM 數(shù)據集:DicomFile 可以容納一個完整的 DICOM 數(shù)據集,包括多個 DICOM 元素。
- 讀取 DICOM 文件:可以使用 DicomFile 類從磁盤中讀取 DICOM 文件,并將其轉換為 DicomDataset 對象。讀取文件時,可以選擇指定編碼(Encoding)和字節(jié)順序(ByteOrder)。
- 寫入 DICOM 文件:可以使用 DicomFile 類將 DicomDataset 對象寫入到磁盤中,生成一個新的 DICOM 文件。寫入文件時,可以選擇指定編碼(Encoding)和字節(jié)順序(ByteOrder)。
例如:假設有一個包含患者姓名和患者 ID 的 DICOM 數(shù)據集,我們可以使用 DicomFile 類來將其保存到磁盤中:
DicomDataset dataset = new DicomDataset();
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientName, "John Doe"));
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientID, "12345"));
// 將數(shù)據集寫入到磁盤中
string filePath = "C:\\temp\\mydicomfile.dcm";
DicomFile file = new DicomFile(dataset, filePath);
file.Save();
同時,我們也可以從磁盤中讀取 DICOM 文件,并將其轉換為 DicomDataset 對象:
// 從磁盤中讀取 DICOM 文件
DicomFile file = DicomFile.Open(filePath);
// 將文件內容轉換為數(shù)據集
DicomDataset dataset = file.Dataset;
// 獲取元素值
string patientName = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientName);
string patientID = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientID);
通過使用 DicomFile,我們可以方便地進行 DICOM 文件的讀取和寫入,并將文件內容轉換為 DicomDataset 對象。這樣的功能使得在 fo-dicom 中進行 DICOM 數(shù)據處理變得更加簡單和高效。
4、DicomTag(DICOM標簽):
在 fo-dicom 中,DicomTag(DICOM 標簽)是用于表示 DICOM 數(shù)據集中的元素標識符的類。每個 DICOM 元素都有一個唯一的標簽,該標簽指定了元素的類型、值、長度和位置等信息。
DicomTag 類具有以下特點和功能:
- 表示 DICOM 元素標識符:DicomTag 類用于表示 DICOM 數(shù)據集中元素的標識符,包括元素的組號和元素號。
- 獲取標簽屬性:可以使用 DicomTag 類獲取標簽的屬性,如組號、元素號、VR 等。
- 訪問 DICOM 元素:可以使用 DicomTag 類來訪問 DICOM 數(shù)據集中具有特定標簽的元素。
例如:假設有一個包含患者姓名和患者 ID 的 DICOM 數(shù)據集。我們可以使用 DicomTag 類來創(chuàng)建和訪問這些元素:
// 創(chuàng)建標簽
DicomTag patientNameTag = new DicomTag(0x0010, 0x0010);
DicomTag patientIDTag = new DicomTag(0x0010, 0x0020);
// 獲取標簽屬性
int groupNumber = patientNameTag.Group;
int elementNumber = patientNameTag.Element;
string vr = patientNameTag.VR.Code;
// 訪問 DICOM 元素
DicomDataset dataset = new DicomDataset();
dataset.Add(new DicomElement(patientNameTag, "John Doe"));
dataset.Add(new DicomElement(patientIDTag, "12345"));
string patientName = dataset.GetSingleValue<string>(patientNameTag);
string patientID = dataset.GetSingleValue<string>(patientIDTag);
通過使用 DicomTag,我們可以方便地創(chuàng)建、訪問和操作 DICOM 數(shù)據集中的元素標識符。這樣的功能使得在 fo-dicom 中進行 DICOM 數(shù)據處理變得更加簡單和高效。
特別需要注意的是:每個新版本的 DICOM 標準發(fā)布時,都可能會有新的 DICOM 標簽的增加或舊標簽的刪除。DICOM 標準不斷發(fā)展和演變,以適應醫(yī)療領域的需求和技術進步。DICOM 標準由國際電工委員會(IEC)和國際標準化組織(ISO)共同制定和管理,經過廣泛的行業(yè)參與和專家審查。每個新版本的 DICOM 標準都會根據醫(yī)療實踐的需求和技術的發(fā)展進行更新和擴展。新版本的 DICOM 標準通常會引入新的標簽,以支持新的圖像、測量、功能等。這些新標簽可以用于描述新的醫(yī)療設備、新的圖像處理算法或新的數(shù)據需求。
同時,舊版本的 DICOM 標簽也可能會被刪除或廢棄。一些標簽在新版本中可能不再使用,因為它們已經過時或不再符合當前的醫(yī)療實踐。這樣的修改可以確保 DICOM 標準的準確性、一致性和適應性。
因此,了解和跟蹤最新的 DICOM 標準版本對于正確解釋和處理 DICOM 數(shù)據集非常重要。開發(fā)人員和用戶需要及時了解最新版本的 DICOM 標準,并確保使用的庫或工具能夠支持該版本以獲取最佳的兼容性和功能。
5、DicomServiceClass(DICOM服務類):
在 fo-dicom 中,DicomService(DICOM 服務)是一個抽象類,用于表示與 DICOM 網絡通信相關的服務。它提供了一組方法和屬性,用于建立 DICOM 連接、執(zhí)行 DICOM 操作以及處理 DICOM 數(shù)據。
DicomService 包括以下基本概念:
- 連接:DicomService 提供了建立和管理 DICOM 連接的功能。它可以作為一個服務端監(jiān)聽傳入的連接請求,也可以作為一個客戶端發(fā)起連接到遠程服務器。
- 操作:DicomService 定義了執(zhí)行各種 DICOM 操作的方法。這些操作包括查詢、檢索、存儲、發(fā)送等。使用這些方法,可以向遠程 DICOM 設備發(fā)送請求,并接收和處理響應。
- 事件:DicomService 提供了一組事件,用于捕獲和處理與 DICOM 通信相關的事件。例如,可以通過處理 OnConnectionClosed 事件來處理連接關閉的情況,或者通過處理 OnCStoreRequest 事件來處理存儲請求。
例如:以 DicomServer 類為例,它是 fo-dicom 中用于實現(xiàn) DICOM 服務端的具體類。以下是一個示例代碼:
// 創(chuàng)建 DICOM 服務端實例
DicomServer server = new DicomServer();
// 設置服務端的參數(shù)和配置
server.AETitle = "MY_AE_TITLE";
server.Port = 11112;
// 處理連接建立的事件
server.OnConnectionRequest += (sender, e) =>
{
Console.WriteLine("收到連接請求:" + e.Association.CallingAETitle);
// 接受連接請求
e.AcceptAssociation();
};
// 處理存儲請求的事件
server.OnCStoreRequest += (sender, e) =>
{
Console.WriteLine("收到存儲請求:" + e.File.Dataset.GetSingleValueOrDefault<string>(DicomTag.PatientName, ""));
// 存儲請求處理邏輯...
// 發(fā)送存儲響應
e.SendResponse(DicomStatus.Success);
};
// 啟動服務端并開始監(jiān)聽連接
server.Start();
Console.WriteLine("DICOM 服務端已啟動,監(jiān)聽端口:" + server.Port);
// 等待用戶按下任意鍵停止服務端
Console.ReadKey();
// 停止服務端
server.Stop();
Console.WriteLine("DICOM 服務端已停止。");
在上述示例中,我們創(chuàng)建了一個 DicomServer 實例,并設置了服務端的參數(shù),如 AE 標題和監(jiān)聽端口。然后,我們通過訂閱 OnConnectionRequest 事件來處理傳入的連接請求,當收到連接請求時,打印相應的消息并接受該連接。同時,我們還訂閱了 OnCStoreRequest 事件來處理存儲請求,在收到存儲請求時,打印患者姓名并發(fā)送存儲響應。最后,我們啟動服務端并開始監(jiān)聽連接。
通過使用 DicomService 的具體實現(xiàn),如 DicomServer,我們可以方便地實現(xiàn)自定義的 DICOM 服務端或客戶端,并處理與 DICOM 通信相關的各種操作和事件。這使得在 fo-dicom 中進行 DICOM 網絡通信變得更加靈活和可定制。
這一塊是DICOM通信部分非常重要的內容。后續(xù)我會重點分析這個部分的內容,期待分享。
6、DicomImage(DICOM圖像):
在 fo-dicom 中,DicomImage(DICOM 圖像)是一個用于表示 DICOM 圖像數(shù)據的類。它提供了一組方法和屬性,用于加載、顯示和處理 DICOM 圖像。
DicomImage 包括以下基本概念:
- 數(shù)據集:DicomImage 是基于一個 DICOM 數(shù)據集構建的。該數(shù)據集通常包含有關圖像的元數(shù)據信息,如像素數(shù)據大小、采樣率、顏色空間等。使用 DicomFile 或 DicomDataset 類可以從 DICOM 文件或數(shù)據流中讀取數(shù)據集。
- 像素數(shù)據:DicomImage 還包含一個或多個像素數(shù)據數(shù)組,這些數(shù)組存儲了圖像的像素值。使用 GetPixelData 方法可以獲取像素數(shù)據數(shù)組。根據圖像的顏色空間和位深度,可以使用不同的像素數(shù)據類型來表示像素值。
- 顯示:DicomImage 提供了一組方法和屬性,用于在圖像視圖中顯示圖像。可以使用 WPF 或 WinForms 控件來實現(xiàn)具體的圖像顯示。
例如:以 DicomImage 類為例,以下是一個示例代碼:
// 從 DICOM 文件中加載圖像數(shù)據集
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open("image.dcm");
DicomImage dicomImage = new DicomImage(dicomFile.Dataset);
// 獲取圖像的像素數(shù)據數(shù)組
ushort[] pixelData = dicomImage.GetPixelData<ushort>();
// 顯示圖像
WpfImageViewer imageViewer = new WpfImageViewer();
imageViewer.Image = dicomImage.RenderImage();
imageViewer.Show();
在上述示例中,我們首先使用 DicomFile 類從 DICOM 文件中讀取圖像數(shù)據集,然后創(chuàng)建一個 DicomImage 實例,并將數(shù)據集作為參數(shù)傳遞。接下來,我們使用 GetPixelData 方法獲取像素數(shù)據數(shù)組,并將其存儲到 pixelData 變量中。最后,我們使用 WpfImageViewer 控件顯示圖像。
通過使用 DicomImage 類,我們可以輕松地加載、顯示和處理 DICOM 圖像數(shù)據。這使得在 fo-dicom 中進行 DICOM 圖像處理變得更加方便和高效。
總結
上面介紹的這些基本概念,只是眾多內容中的一小部分,僅僅因為這些概念在使用fo-dicom期間經常被引用,理解它們的含義和使用方法對于成功處理DICOM數(shù)據非常重要。