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Google的大數(shù)據(jù)基因組學(xué)夢(mèng)

數(shù)據(jù)庫(kù)
未來(lái),在 Google 上搜索一個(gè)人,將會(huì)呈現(xiàn)出一種全新的結(jié)果?,F(xiàn)在,位于山景城的硅谷巨頭 Google 邀請(qǐng)遺傳學(xué)家將手中的遺傳信息上傳到該公司開(kāi)發(fā)的云設(shè)施上,與此同時(shí), Google 還為科學(xué)家提供了如何導(dǎo)入、處理、存儲(chǔ)以及搜索 DNA 數(shù)據(jù)的操作說(shuō)明。

 

Google向基因組學(xué)進(jìn)軍,可以為那些已經(jīng)在醫(yī)療保健領(lǐng)域投入大量資金的公司打開(kāi)更為廣闊的市場(chǎng)。加州大學(xué)洛杉磯分校安德森商學(xué)院副教授、從事技術(shù)兼并與收購(gòu)的George Geis表示:“使用基因組分析方法的所有領(lǐng)域,通常來(lái)說(shuō)都是熱點(diǎn)領(lǐng)域。”

根據(jù)市場(chǎng)研究公司 MarketsandMarkets發(fā)布的一份報(bào)告顯示,2013年,全球基因組學(xué)市場(chǎng)為110億美元,到2018年,該市場(chǎng)預(yù)計(jì)會(huì)增長(zhǎng)到190億美元。北美醫(yī)療保健云計(jì)算市場(chǎng)在此期間也會(huì)快速增長(zhǎng),預(yù)計(jì)增長(zhǎng)30%,達(dá)到65億美元。

龐大的數(shù)據(jù)庫(kù)

人類(lèi)基因組測(cè)序能夠揭示致命的突變,幫助科學(xué)家發(fā)現(xiàn)可拯救生命的藥物,但個(gè)體基因組數(shù)據(jù)不是一個(gè)小數(shù)目,一個(gè)人的基因組數(shù)據(jù)加起來(lái)約有100GB,研究人員必須進(jìn)行嚴(yán)格的分析才能在巨大的數(shù)據(jù)庫(kù)中窺探到自己所需要的信息。

與此同時(shí),科學(xué)家和企業(yè)必須回答關(guān)于這些信息存儲(chǔ)在哪里,誰(shuí)有訪問(wèn)權(quán)限,以及怎樣保護(hù)隱私等問(wèn)題。

為了幫助解決這些問(wèn)題, Google最近加入全球基因組學(xué)與健康聯(lián)盟(Global Alliance for Genomics and Health)——一個(gè)由醫(yī)療機(jī)構(gòu)、研究型大學(xué)、生命科學(xué)公司等構(gòu)成的聯(lián)盟組織。該聯(lián)盟在這個(gè)月舉行了***會(huì)談,他們希望業(yè)界能夠集中資源,建立起如何管理這些數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)。

進(jìn)軍健康領(lǐng)域

目前, Google 正在為遺傳學(xué)界提供免費(fèi)的Web服務(wù),但Geis認(rèn)為:“在他們往前發(fā)展的過(guò)程中,很可能會(huì)有某種東西產(chǎn)生高利潤(rùn)。”

該公司正迅速擴(kuò)張到健康和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。Google擁有一家開(kāi)發(fā)延長(zhǎng)人類(lèi)壽命方法的生物技術(shù)公司 Calico。2014 年 1 月, Google 推出一款旨在幫助糖尿病患者監(jiān)測(cè)血糖的隱形眼鏡。它還使用數(shù)據(jù)聚合搜索來(lái)估算超過(guò) 25 個(gè)國(guó)家的流感活動(dòng),以及提供個(gè)人健康記錄業(yè)務(wù)——用戶(hù)能夠隨時(shí)在線(xiàn)創(chuàng)建自己的藥物、過(guò)敏和檢查結(jié)果等健康資料。

Google新推出的可監(jiān)測(cè)糖尿病的隱形眼鏡

總有一天,Google能利用掌握的基因數(shù)據(jù)做出自己的醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn)。 Geis表示:“這很有可能將 Google 變成另一種類(lèi)型的公司——與一家制藥公司做搭檔,或?yàn)樽约旱目茖W(xué)發(fā)現(xiàn)發(fā)放許可證和專(zhuān)利。”

但是在基因組學(xué)領(lǐng)域, Google已經(jīng)面臨著大大小小的公司的競(jìng)爭(zhēng)。

2012 年,亞馬遜(Amazon)的云服務(wù)接管?chē)?guó)際千人基因組計(jì)劃數(shù)據(jù)存儲(chǔ),這是世界上***的人類(lèi)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。雖然數(shù)據(jù)是公開(kāi)和免費(fèi)的,但是研究人員使用亞馬遜高性能的計(jì)算資源來(lái)運(yùn)行數(shù)據(jù)計(jì)算是收費(fèi)的。

廣闊的發(fā)展空間

Ingenuity 系統(tǒng)公司的聯(lián)合創(chuàng)始人Ramon Felciano 表示:“云空間目前仍處于起步階段,還有很大的發(fā)展空間,特別是將一些企業(yè)特殊的云技術(shù)應(yīng)用到新領(lǐng)域。”Ingenuity主要研發(fā)生物數(shù)據(jù)分析軟件,最近被 Qiagen 收購(gòu)。

Google 的 DNA Nexus提供基因數(shù)據(jù)的云存儲(chǔ)。 Google ***云計(jì)算總監(jiān)(Chief Cloud Officer) Omar Serang表示, Google加入全球基因組學(xué)和健康聯(lián)盟,是因?yàn)樵谀壳暗幕蚪M數(shù)據(jù)處理領(lǐng)域沒(méi)有一個(gè)通用的標(biāo)準(zhǔn)或格式,科學(xué)家和企業(yè)不能進(jìn)行深入研究。

Felciano 認(rèn)為:“信息是非常孤立的。”由于病人的隱私問(wèn)題,基因數(shù)據(jù)的敏感性也通常會(huì)阻止非常簡(jiǎn)單的協(xié)作。

電子前沿基金會(huì)的資深專(zhuān)職律師李田(Lee Tien)認(rèn)為:“基因研究的整個(gè)領(lǐng)域,特別是基于大數(shù)據(jù)和測(cè)序數(shù)據(jù)的基因研究,充滿(mǎn)了隱私和倫理問(wèn)題。

隱私標(biāo)準(zhǔn)

雖然醫(yī)院和學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)必須遵守保護(hù)病人隱私的規(guī)則,但私人公司并不一定遵循這些標(biāo)準(zhǔn),李田說(shuō)。

全球基因組學(xué)與健康聯(lián)盟成員正著手制定監(jiān)管倫理、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和安全的公共策略。就其本身而言, Google 表示,存儲(chǔ)在其云端的基因組數(shù)據(jù)是安全的。該公司在其網(wǎng)站上表示:“私人數(shù)據(jù)依然保密,公共數(shù)據(jù)開(kāi)放給任何人。”。

李田對(duì)此依然保持謹(jǐn)慎態(tài)度。“也許一切會(huì)很順利。”他說(shuō),“但是其他情況下可能會(huì)有意想不到的事情——對(duì)于遺傳數(shù)據(jù),我們可都不希望出現(xiàn)意料外的事情。”

責(zé)任編輯:彭凡 來(lái)源: 生物360
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