極道承載生物大數(shù)據(jù)以科技助力疫情防控
石家莊多例新冠肺炎感染病例備受關(guān)注,“中國速度”再次開啟,這座千萬級(jí)人口的城市3天就完成了首次核酸檢測,多輪全員核酸檢測正在進(jìn)行中。醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)為新冠肺炎病毒相關(guān)研究提供了數(shù)據(jù)采集與分析,與2020年初相比,此次大規(guī)??焖俸怂釞z測表現(xiàn)出了更好的及時(shí)性,也是海量存儲(chǔ)和快速檢測技術(shù)的一次良好利用。
為提高診斷效率,更多符合條件的第三方機(jī)構(gòu)也開始參與核酸檢測,獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室的重要性又一次顯現(xiàn),充分發(fā)揮其在基因測序領(lǐng)域的技術(shù)和科研優(yōu)勢(shì),為公眾提供快速、準(zhǔn)確的核酸篩查服務(wù)。
極道長期服務(wù)于多家知名基因科技公司和臨床檢測機(jī)構(gòu),為高通量的基因測序數(shù)據(jù)分析提供高性能數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、數(shù)據(jù)管理和數(shù)據(jù)計(jì)算產(chǎn)品。自新冠肺炎疫情爆發(fā)以來,針對(duì)臨床檢測、疫苗研發(fā)等工作中產(chǎn)生的各種海量數(shù)據(jù),極道利用自己的數(shù)據(jù)系統(tǒng)技術(shù)優(yōu)勢(shì),全力支持新冠病毒基因組裝,變異追蹤。
極道高性能存儲(chǔ)系統(tǒng)ANNA和ABC計(jì)算系統(tǒng)Achelous的完美配合,極大的加速了海量病毒數(shù)據(jù)的快速處理和分析,利用極道強(qiáng)關(guān)聯(lián)大規(guī)模數(shù)據(jù)特征管理進(jìn)行樣本數(shù)據(jù)的溯源追蹤,為檢測機(jī)構(gòu)高效管理和科學(xué)決策搭建了智能的數(shù)據(jù)系統(tǒng)平臺(tái)。
多年積累,應(yīng)對(duì)生物數(shù)據(jù)的“海量”與“多樣性”
在對(duì)海量生物數(shù)據(jù)中的深刻規(guī)律進(jìn)行研究時(shí),極道發(fā)現(xiàn),生物樣本檢測數(shù)據(jù)的分析和解讀具有數(shù)據(jù)量大、數(shù)據(jù)多樣性、處理數(shù)據(jù)效率高、對(duì)數(shù)據(jù)管理需要簡化以快速獲取、檢索和組合等行業(yè)特點(diǎn)。借助這些特點(diǎn),才可以實(shí)現(xiàn)檢測結(jié)果高效和準(zhǔn)確。
針對(duì)海量生物數(shù)據(jù),極道高性能分布式統(tǒng)一存儲(chǔ)系統(tǒng)ANNA可以通過高通量高可靠的并行集群文件存儲(chǔ)系統(tǒng),支持在線增加存儲(chǔ)單元橫向擴(kuò)展存儲(chǔ)的容量和性能,整體系統(tǒng)無單點(diǎn)瓶頸,滿足存儲(chǔ)系統(tǒng)對(duì)數(shù)據(jù)處理能力和擴(kuò)展性的要求。
ANNA每個(gè)控制器均可以作為訪問入口承接外部數(shù)據(jù)需求,每個(gè)存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)都可以輕松達(dá)到網(wǎng)絡(luò)帶寬上限,面對(duì)高性能客戶需求訪問存儲(chǔ)系統(tǒng)時(shí)可以提供極致的讀寫帶寬性能。針對(duì)海量的測序數(shù)據(jù),ANNA可以對(duì)數(shù)據(jù)和元數(shù)據(jù)進(jìn)行分離存儲(chǔ),以便在存儲(chǔ)業(yè)務(wù)繁忙時(shí),元數(shù)據(jù)從操作的響應(yīng)速度和性能均能得到保證,同時(shí)滿足高帶寬和元數(shù)據(jù)高IOPS需求。
通過強(qiáng)大的數(shù)據(jù)管理與服務(wù)能力,極道高性能分布式統(tǒng)一存儲(chǔ)系統(tǒng)ANNA消除了擴(kuò)展存儲(chǔ)架構(gòu)和存儲(chǔ)性能局限。同時(shí),ANNA面對(duì)海量數(shù)據(jù)不僅提供存儲(chǔ)空間,配合極道數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)MetaView,能夠自動(dòng)捕捉數(shù)據(jù)的多樣化特征,建立高效索引,快速發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)和溯源數(shù)據(jù),解決了生物基因領(lǐng)域?qū)?shù)據(jù)處理效率、數(shù)據(jù)多樣性和長期安全存儲(chǔ)的需求。
極道Achelous數(shù)據(jù)計(jì)算系統(tǒng)和強(qiáng)大的執(zhí)行引擎,在充分發(fā)揮計(jì)算資源利用率的基礎(chǔ)上,最大化數(shù)據(jù)并行、算法并行和模型并行,極道協(xié)助臨床檢測公司和抗疫科研機(jī)構(gòu)進(jìn)一步加速了病毒數(shù)據(jù)的分析周期和提升了數(shù)據(jù)分析處理效率。
抓住新趨勢(shì),持續(xù)助力生物基因領(lǐng)域
生命科學(xué)對(duì)于疫情的幫助,不僅限于分子生物學(xué)診斷、毒株鑒定以及疫苗生產(chǎn),還包括預(yù)防醫(yī)學(xué)、流行病學(xué)等。因此,在后疫情時(shí)代,分子診斷、基因測序、第三方醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室將逆勢(shì)成長,生物基因與信息技術(shù)的融合也將更緊密,深刻體現(xiàn)了前沿信息技術(shù)與現(xiàn)代生命科學(xué)的交叉,也讓極道看準(zhǔn)了精準(zhǔn)醫(yī)療、個(gè)性化醫(yī)療這一未來發(fā)展趨勢(shì)。
多年來,極道深耕生物基因領(lǐng)域,為多家醫(yī)院、基因組學(xué)研究所、生命科學(xué)研究企業(yè)、腫瘤臨床治療中心等單位提供產(chǎn)品和解決方案,支持醫(yī)療影像、基因測序、藥品研發(fā)等應(yīng)用的穩(wěn)定運(yùn)行。未來,極道仍將不斷提供創(chuàng)新的技術(shù)與產(chǎn)品,為生物基因技術(shù)的快速發(fā)展發(fā)揮重要作用。