百度開源“神經(jīng)條件隨機場”病理切片分析算法,準(zhǔn)確率超專業(yè)病理醫(yī)生
近日,百度研究院在發(fā)表的論文中提出了“神經(jīng)條件隨機場”的病理切片分析算法,并且在Github上開源了整套算法代碼。
該算法在公開數(shù)據(jù)集Camelyon16大賽測試集上,定位FROC分數(shù)為0.8096,超過專業(yè)病理醫(yī)生水平以及由哈佛和麻省理工學(xué)院聯(lián)合團隊所保持的最好成績。
病理切片分析是癌癥診斷中的基本標(biāo)準(zhǔn),即便是經(jīng)驗豐富的病理醫(yī)生,對于切片的精準(zhǔn)度把握也不會達到100%。一張40倍放大的電子化病理切片通常由超過十億個像素點組成,磁盤空間大小超過1GB。然而淋巴結(jié)附近微轉(zhuǎn)移腫瘤細胞群可能最小只有不到1000像素的直徑。而一旦發(fā)現(xiàn)微轉(zhuǎn)移腫瘤細胞群,病人的治療方案和預(yù)后可能就會有極大差別。
百度研究院提出的“神經(jīng)條件隨機場”是一種深度學(xué)習(xí)算法,一次性輸入一組3x3的圖塊,并聯(lián)合預(yù)測每一張圖塊是否有腫瘤區(qū)域,圖塊之間的空間關(guān)系可以通過一種名為“條件隨機場”的概率圖模型來模擬。整套算法框架可以在GPU上進行端到端的訓(xùn)練,而不需任何后處理的步驟。