華大基因成立于1999年9月9日，其基因的測(cè)序能力及基因組分析能力處于***地位。在多年的發(fā)展中，華大基因建設(shè)了一支具有世界***水平的、年輕的產(chǎn)學(xué)研隊(duì)伍，開展了廣泛的國際國內(nèi)科技合作與交流，開創(chuàng)了科學(xué)、技術(shù)、產(chǎn)業(yè)相互推動(dòng)的發(fā)展模式，在基因組科學(xué)和產(chǎn)業(yè)發(fā)展領(lǐng)域再現(xiàn)了深圳速度和深圳奇跡。

高性能計(jì)算集群（HPCC）是基因研究工作的重要工具，基因的測(cè)序、數(shù)據(jù)處理、比對(duì)分析和結(jié)果提取等，都要在HPCC上進(jìn)行。為了確保基因研究工作能夠高效進(jìn)行，華大基因?qū)PCC系統(tǒng)的建設(shè)，以及其中核心部件處理器的篩選，都非常重視。

就在最近，隨著研究項(xiàng)目的增多，華大基因之前建設(shè)的HPCC平臺(tái)開始逐漸顯得有些力不從“芯”，為此華大基因又把目光投向了***一代的多核處理器，計(jì)劃篩選最“強(qiáng)悍實(shí)用”的多核處理器來升級(jí)HPCC系統(tǒng)。

華大基因?qū)κ袌?chǎng)上的新一代多核處理器進(jìn)行了全面的對(duì)比分析，更結(jié)合實(shí)際工作進(jìn)行了深入的測(cè)試。最終，華大基因決定全面引入基于AMD六核“伊斯坦布爾”處理器的戴爾刀片服務(wù)器，升級(jí)其HPCC系統(tǒng)。

華大基因采用68片戴爾M605刀片服務(wù)器和5個(gè)M1000e刀片服務(wù)器機(jī)箱實(shí)施升級(jí)，刀片服務(wù)器配置為：AMD六核皓龍2435處理器（代號(hào)“伊斯坦布爾”，2.6GHz）；16GB內(nèi)存（8×2GB）；一塊146GB的SATA硬盤。刀片服務(wù)器全部被插裝在M1000e機(jī)箱內(nèi)，機(jī)箱均通過萬兆線纜與萬兆交換機(jī)相連，從而構(gòu)成一個(gè)刀片式的萬兆高性能并行計(jì)算網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)。該HPCC系統(tǒng)的管理節(jié)點(diǎn)是一臺(tái)機(jī)架式服務(wù)器，后端存儲(chǔ)則采用的是Panasas設(shè)備。

華大基因高性能計(jì)算主任方林表示：“我們以為AMD‘伊斯坦布爾’處理器是目前性價(jià)比***的多核處理器。在性能上比前代產(chǎn)品至少提升20%，同時(shí)還有價(jià)格優(yōu)勢(shì)。我們?cè)诖罅恳階MD新一代六核處理器后，計(jì)算能力大概提升了兩倍。這有力地推動(dòng)了研究項(xiàng)目的開展，包括熊貓基因序列研究、中丹合作的糖尿病基因研究，中美英合作的千人基因組研究和人體腸道元基因組研究等在內(nèi)的多個(gè)重大項(xiàng)目的進(jìn)程，都有了不同幅度的加快，很多項(xiàng)目都將早出成果、多出成果。”

如今華大基因的HPCC平臺(tái)每天要產(chǎn)出大概10個(gè)T左右的數(shù)據(jù)，這個(gè)數(shù)據(jù)是非常驚人的，因?yàn)楹芏啻笮推髽I(yè)一年的業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)都沒有10個(gè)T。在如此繁重的計(jì)算任務(wù)面前，基于伊斯坦布爾處理器的戴爾M605刀片服務(wù)器以穩(wěn)定、高效和可靠的性能，實(shí)現(xiàn)了無故障運(yùn)行。