亞馬遜云科技啟動(dòng)新一階段“診斷開發(fā)計(jì)劃”, 并進(jìn)一步擴(kuò)大資助范圍
2021年4月13日,亞馬遜云科技宣布啟動(dòng)新一階段的診斷開發(fā)計(jì)劃。診斷開發(fā)計(jì)劃是亞馬遜云科技于2020年3月推出的全球性項(xiàng)目,致力于幫助世界各地的組織利用云的力量加速疾病診斷研發(fā)。通過(guò)該計(jì)劃,亞馬遜云科技承諾提供2000萬(wàn)美元的計(jì)算額度及專業(yè)服務(wù)團(tuán)隊(duì)的定制化專業(yè)知識(shí)支持,幫助推動(dòng)診斷創(chuàng)新。目前為止,亞馬遜云科技已經(jīng)向包括中國(guó)在內(nèi)的企業(yè)和研究機(jī)構(gòu)提供了800萬(wàn)美元資助,新一階段將分配剩余的1200萬(wàn)美元。同時(shí),新一階段的資助范圍將擴(kuò)大到三個(gè)全新的領(lǐng)域:1)通過(guò)早期疾病檢測(cè)識(shí)別個(gè)體和社區(qū)層面的疾病爆發(fā);2)通過(guò)預(yù)后更好地了解疾病軌跡;3)通過(guò)公共衛(wèi)生基因組學(xué)支持全球病毒基因組測(cè)序。
在該計(jì)劃的第一階段,亞馬遜云科技已經(jīng)幫助了包括中國(guó)在內(nèi)的17個(gè)國(guó)家的87個(gè)組織,包括非營(yíng)利組織、研究機(jī)構(gòu)、初創(chuàng)企業(yè)、和大型企業(yè),所支持的診斷項(xiàng)目包括:抗體、抗原和核酸的分子測(cè)試、診斷成像、可穿戴設(shè)備、以及使用人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)檢測(cè)病毒的數(shù)據(jù)分析工具,等等。
新一階段,亞馬遜云科技將繼續(xù)優(yōu)先考慮新冠疫情項(xiàng)目,同時(shí)也將評(píng)估關(guān)注其它傳染病的項(xiàng)目。4月12日起,到2021年年底,全球各類感興趣的組織都可以申請(qǐng)這一計(jì)劃,但亞馬遜云科技將優(yōu)先考慮7月31日前收到的申請(qǐng)。有興趣的組織可放問(wèn)以下鏈接申請(qǐng)https://aws.amazon.com/government-education/nonprofits/disaster-response/diagnostic-dev-initiative/ 。
“從機(jī)器學(xué)習(xí)驅(qū)動(dòng)的X光圖像分析,到快速、高質(zhì)量和直接面向大眾的檢測(cè)方式,過(guò)去一年我們看到了疾病診斷方式的眾多革命性創(chuàng)新。”亞馬遜新冠疫情響應(yīng)首席醫(yī)療官Vin Gupta博士表示,“這些創(chuàng)新還將持續(xù)發(fā)生,不斷提高我們應(yīng)對(duì)未來(lái)疫情爆發(fā)的能力。診斷開發(fā)計(jì)劃已經(jīng)帶來(lái)了一系列鼓舞人心的成果。我們也期待,通過(guò)幫助更多組織和社區(qū)更好地利用云計(jì)算技術(shù),能夠更快地識(shí)別和應(yīng)對(duì)未來(lái)可能發(fā)生的疫情。”
第一階段亮點(diǎn)項(xiàng)目舉例
亞馬遜云科技診斷開發(fā)計(jì)劃加速了多個(gè)對(duì)新冠病毒檢測(cè)有直接作用的項(xiàng)目,為醫(yī)療診斷帶來(lái)了更多可能性。這些項(xiàng)目不僅幫助醫(yī)學(xué)界快速應(yīng)對(duì)新冠疫情,還支持了許多用以應(yīng)對(duì)其它傳染病的重要工作。
以下是亞馬遜云科技診斷開發(fā)計(jì)劃所支持項(xiàng)目的幾個(gè)典型代表。
晶泰科技推動(dòng)老藥新用篩查
總部位于深圳,在北京、波士頓、上海設(shè)有分部的晶泰科技(XtalPi),是一家以數(shù)字化、智能化驅(qū)動(dòng)藥物研發(fā)創(chuàng)新的科技公司。在新冠疫情爆發(fā)后,該公司很快對(duì)近3000個(gè)已通過(guò)美國(guó)藥監(jiān)局(FDA)審核的上市藥物、以及超過(guò)1萬(wàn)種中藥成分分子,進(jìn)行了老藥新用的掃描,成功找到了183個(gè)可能對(duì)新冠病毒有潛在治療效果的藥物。之后,晶泰科技對(duì)這些藥物的活性進(jìn)行了排序,又通過(guò)更加高精度的計(jì)算化學(xué)方法,鎖定了38個(gè)潛在有效的藥物,與合作伙伴分享。晶泰科技能迅速地完成大量藥物篩選,得益于其Intelligent Digital Drug Discovery and Development (ID4)云端智能藥物研發(fā)平臺(tái)。在這個(gè)平臺(tái)上,晶泰科技通過(guò)自主研發(fā)的基于GPU計(jì)算實(shí)例的機(jī)器學(xué)習(xí)框架,實(shí)現(xiàn)大規(guī)模的模型訓(xùn)練及參數(shù)優(yōu)化。在AI模型研究及設(shè)計(jì)初期,晶泰科技的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)通過(guò)Amazon SageMaker服務(wù)實(shí)現(xiàn)了對(duì)模型及參數(shù)的快速驗(yàn)證,其友好的交互式界面加速了算法研發(fā)效率。憑借準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)與海量計(jì)算資源的支撐,晶泰科技的ID4平臺(tái)已經(jīng)加速了超過(guò)100款管線藥物的研發(fā),正在并行推進(jìn)超過(guò)30款新藥的藥物發(fā)現(xiàn)工作。
“ID4智能藥物研發(fā)平臺(tái)至今已服務(wù)幾十家藥企,在速度、精確度、安全性上的優(yōu)勢(shì)越來(lái)越多地受到藥物創(chuàng)新企業(yè)的認(rèn)可和青睞。這離不開亞馬遜云科技強(qiáng)大的計(jì)算、存儲(chǔ)、人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)等眾多服務(wù)的支持。我們希望能夠利用ID4平臺(tái),為藥企提供強(qiáng)大的藥物研發(fā)引擎,做藥企創(chuàng)新研發(fā)道路上的有力伙伴,以優(yōu)勢(shì)明顯的研發(fā)服務(wù),進(jìn)一步推動(dòng)藥物研發(fā)的智能化進(jìn)程。”晶泰科技CTO劉陽(yáng)表示。
益體康以遠(yuǎn)程心電診斷服務(wù)基層醫(yī)療
益體康專注遠(yuǎn)程醫(yī)療服務(wù),為眾多醫(yī)療健康服務(wù)機(jī)構(gòu)提供產(chǎn)品與技術(shù)支持。新冠疫情期間,益體康的遠(yuǎn)程心電服務(wù)打破了檢查端和診斷端的空間限制,為身處隔離病房的新冠肺炎患者提供了及時(shí)的心電診斷,同時(shí),也讓眾多基層醫(yī)院的病患在大型醫(yī)院減少或暫停普通疾病接診的情況下,依然可以得到專業(yè)的心臟問(wèn)題初診和分診,從而降低了因密切接觸導(dǎo)致新冠肺炎感染的可能性。在2020年,益體康搭建于亞馬遜云科技上的心電診斷中心共計(jì)支持了超過(guò)1000所基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)的超過(guò)11萬(wàn)例遠(yuǎn)程心電診斷。亞馬遜云科技大大提升了益體康A(chǔ)I模型訓(xùn)練和更新的效率,并降低了數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的成本。
“在心電領(lǐng)域,醫(yī)學(xué)上已經(jīng)證明了QT間期延長(zhǎng)綜合征和新冠肺炎之間有非常強(qiáng)的相關(guān)性,后續(xù)希望通過(guò)亞馬遜云科技的機(jī)器學(xué)習(xí)服務(wù)針對(duì)這種已經(jīng)證明的相關(guān)性單獨(dú)訓(xùn)練出一套預(yù)測(cè)模型,并嘗試關(guān)聯(lián)冠狀病毒引起的多種疾病之間的相關(guān)性。”益體康(北京)科技有限公司副總裁/CTO趙俊淋表示。
圖1、圖2 益體康遠(yuǎn)程心電服務(wù)支持基層醫(yī)療
斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院開發(fā)基于智能手表的診斷 "報(bào)警系統(tǒng)"
斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)療創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室的研究人員開發(fā)了一款智能手表應(yīng)用,旨在準(zhǔn)確標(biāo)記出個(gè)體免疫系統(tǒng)抵抗?jié)撛谛鹿诟腥镜嫩E象。該應(yīng)用通過(guò)算法檢測(cè)個(gè)人靜息心率和步數(shù)的變化。早期試驗(yàn)結(jié)果喜人,在一項(xiàng)試驗(yàn)性測(cè)試中,這個(gè)應(yīng)用成功地在新感染者發(fā)現(xiàn)癥狀10天之前就發(fā)出了可能的感染預(yù)警。該應(yīng)用目前已進(jìn)入新一階段的研究,斯坦福大學(xué)團(tuán)隊(duì)正在招募參與者,目標(biāo)是達(dá)到1000萬(wàn)名參與者,以提高其實(shí)時(shí)檢測(cè)新冠肺炎感染跡象的能力。這款基于智能手表的早期檢測(cè)系統(tǒng)構(gòu)建在亞馬遜云科技上。在應(yīng)用構(gòu)建過(guò)程中,亞馬遜云科技專業(yè)服務(wù)團(tuán)隊(duì)與研究人員協(xié)作,在該項(xiàng)研究中幫助擴(kuò)展數(shù)據(jù)處理管道。
圖3 斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院開發(fā)的新冠疫情可穿戴研究App
“我們希望利用可穿戴設(shè)備進(jìn)行的持續(xù)篩查能夠提供可擴(kuò)展的診斷解決方案,以克服現(xiàn)有的檢測(cè)障礙。同時(shí),通過(guò)將數(shù)據(jù)訪問(wèn)范圍擴(kuò)大到更廣泛的研究人員,我們希望能夠推動(dòng)更多新的發(fā)現(xiàn),改善人類健康。我們也期待利用云計(jì)算帶來(lái)更多新的研究的可能性。”斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)教授兼主席Michael Snyder博士表示。
Helix在全美普及高靈敏度新冠檢測(cè)
Helix是一家基因組學(xué)初創(chuàng)公司,其整個(gè)軟件平臺(tái)都建立在亞馬遜云科技上。Helix正在迅速拓展高靈敏度分子新冠檢測(cè)的使用范圍,幫助美國(guó)各地的衛(wèi)生系統(tǒng)、雇主、政府和其它組織實(shí)現(xiàn)次日出檢測(cè)結(jié)果。Helix®新冠肺炎檢測(cè)解決方案已經(jīng)獲得美國(guó)食品和藥品管理局(FDA)的緊急使用授權(quán)。該公司正在擴(kuò)大規(guī)模,以便處理在美國(guó)每天多達(dá)10萬(wàn)次的新冠檢測(cè),使其成為美國(guó)最大的新冠檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室之一。Helix提供了端到端、高度可擴(kuò)展的解決方案,既可以通過(guò)鼻拭子輕松實(shí)現(xiàn)樣本的自我采集,同時(shí)支持無(wú)監(jiān)督或受監(jiān)督的現(xiàn)場(chǎng)樣本采集,檢測(cè)新冠病毒感染。
“與亞馬遜云科技合作,不僅使我們能夠在短時(shí)間內(nèi)搭建起新冠肺炎檢測(cè)解決方案,還使Helix能夠快速擴(kuò)展,滿足去年冬天激增的檢測(cè)需求。其作用是非常巨大的。隨著疫情的惡化,我們能夠在亞馬遜云科技的基礎(chǔ)之上,為全美數(shù)千個(gè)社區(qū)、數(shù)百萬(wàn)人的生命提供幫助。”Helix公司工程副總裁Jim Chou表示。
Centro Diagnostico Italiano和Bracco Imaging創(chuàng)建了開源影像檔案項(xiàng)目
由Centro Diagnostico Italiano和Bracco Imaging領(lǐng)導(dǎo)的醫(yī)療和研究組織聯(lián)盟,協(xié)同創(chuàng)建了AIforCOVID影像檔案,這是一個(gè)擁有近1000張胸部X光片和新冠肺炎患者匿名臨床數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)庫(kù)。聯(lián)盟內(nèi)的多家研究機(jī)構(gòu)開發(fā)了三種機(jī)器學(xué)習(xí)方法,可以在亞馬遜云科技上對(duì)這些圖像和臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行分析?;谶@些分析,聯(lián)盟開發(fā)了一個(gè)模型,能夠通過(guò)胸部X光圖像和臨床數(shù)據(jù),預(yù)測(cè)新冠肺炎患者的臨床結(jié)果。AIforCOVID網(wǎng)絡(luò)收集的所有數(shù)據(jù)都放在項(xiàng)目網(wǎng)站(https://aiforcovid.radiomica.it/),供國(guó)際科技界的成員下載。
圖4 AlforCOVID項(xiàng)目的新冠患者胸部X光片,對(duì)感染區(qū)域的AI劃線(紅色)與手工劃線(綠色)很接近
“在對(duì)新冠患者的管理中,放射影像學(xué)對(duì)診斷和治療方案起著至關(guān)重要的作用。得益于亞馬遜云科技的技術(shù)和專業(yè)支持所帶來(lái)的機(jī)器學(xué)習(xí)力量,我們已經(jīng)能夠快速理解診斷成像和臨床分析所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)。我們正在努力提供實(shí)用的資源,世界各地的醫(yī)院和組織可以應(yīng)用這種資源,增加對(duì)疾病的理解,促進(jìn)自己的診斷工作,改善患者治療。”意大利診斷中心影像診斷和立體定向放射外科主任Sergio Papa表示。
“通過(guò)與Centro Diagnostico Italiano和亞馬遜云科技合作,我們已經(jīng)開始探索將人工智能應(yīng)用于臨床數(shù)據(jù)的潛力。我們意識(shí)到,這場(chǎng)革命才剛剛開始。醫(yī)療正在快速走向一種新的方式,將數(shù)據(jù)與臨床實(shí)踐和患者管理進(jìn)行整合、互聯(lián)。”Bracco全球影像事業(yè)部研發(fā)總監(jiān)Fabio Tedoldi 表示。