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Gpu.js 在醫(yī)學(xué)檢查影像顯示-Web 版的運用

開發(fā) 前端
醫(yī)學(xué)檢查影像顯示里邊,調(diào)窗是一個基礎(chǔ)的常用操作:通過滑動鼠標來改變窗寬窗位的大小,窗寬(寬度)、窗位(中心點)其實就是一個像素數(shù)值的區(qū)間,圖像的所有像素點的像素值在這個區(qū)間的就顯示,不在區(qū)間的就不顯示。

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本文轉(zhuǎn)載自微信公眾號「微醫(yī)大前端技術(shù)」,作者楊廣。轉(zhuǎn)載本文請聯(lián)系微醫(yī)大前端技術(shù)公眾號。

前言

醫(yī)學(xué)檢查影像顯示里邊,調(diào)窗是一個基礎(chǔ)的常用操作:通過滑動鼠標來改變窗寬窗位的大小,窗寬(寬度)、窗位(中心點)其實就是一個像素數(shù)值的區(qū)間,圖像的所有像素點的像素值在這個區(qū)間的就顯示,不在區(qū)間的就不顯示。

在 web 版閱片器(圖像顯示工具)的開發(fā)工程中發(fā)現(xiàn),在對 dr、dx 這種大圖(圖像普遍是 2000px 左右寬高的圖像,每個像素大小是 16 位或者 32 位的)進行調(diào)窗時,瀏覽器直接卡死,圖像顯示變化有很大延遲。后來查閱資料,使用 gpujs 來實現(xiàn)調(diào)窗時圖像的處理,結(jié)果:調(diào)窗時圖像顯示變化變得比較線性,性能估計提升 5/6 倍,能滿足業(yè)務(wù)需求。當(dāng)然,圖像的一些高級處理,都是可以用 gpujs 來實現(xiàn),調(diào)窗只是一個點。

使用前效果:

使用后效果:

什么是 GPU.js?

GPU.js 是用于 Web 和 Node.js 中的 GPGPU(GPU 上的通用計算)的 JavaScript 加速庫。GPU.js 自動將簡單的 JavaScript 函數(shù)轉(zhuǎn)換為著色器語言并編譯它們,以便它們在您的 GPU 上運行。使用 GPU 執(zhí)行大規(guī)模并行 GPGPU 計算,當(dāng) GPU 不可用時,優(yōu)雅的純 JavaScript 回退。

GPU,全稱 Graphics Processing Unit,即圖像處理器,早期主要用于顯示圖像使用。因為圖像處理主要偏簡單的矩陣運算,邏輯判斷等很少,因此 GPU 的設(shè)計跟 CPU 架構(gòu)不一樣,也因此做到一個 GPU 上可以有很多計算單元,可以進行大量并行計算。網(wǎng)上找到一個視頻,應(yīng)該是 Nvidia 某年的產(chǎn)品發(fā)布會,形象地演示了 CPU 跟 GPU 的區(qū)別。http://v.youku.com/vshow/idXNDcyNTc1MjQ4==.html 。知乎上也有對 CPU 和 GPU 的對比 https://www.zhihu.com/question/19903344

例如用 GPU.js 編寫的矩陣乘法(對大小為 512 x 512 的 2 個矩陣執(zhí)行矩陣乘法)。把計算 512 x 512 矩陣(2D 數(shù)組)的單個元素的 javascript 函數(shù)轉(zhuǎn)換而來的 GPU 加速內(nèi)核。內(nèi)核函數(shù)在 GPU 上串聯(lián)運行,通常會導(dǎo)致非??焖俚挠嬎?你可以在這里運行一個基準測試。通常,它的運行速度會快 1-15 倍,具體取決于您的硬件。

由于架構(gòu)設(shè)計不一樣,GPU 很適合做簡單的并發(fā)計算,應(yīng)用于圖像處理、深度學(xué)習(xí)等領(lǐng)域能大大加快速度。當(dāng)然直接用 gpu 去開發(fā)程序很難編寫,一般都是由特殊編譯器將代碼編譯成可以在 gpu 上執(zhí)行的代碼。本文提到的 gpu.js 就是在前端將 js 的一個子集編譯成能在 webgl 上執(zhí)行的一個編譯器。更多使用場景 demo 請參照官網(wǎng) https://gpu.rocks/#/examples。

在使用上遇到的坑

使用 npm 引入 gpu.js 包,發(fā)現(xiàn)項目運行不起來,可能和機器有關(guān)系,后來改成直接用 browser 方式引入 js 文件

我們是使用 canvas 方式來直接輸出像素數(shù)據(jù)的,對不同大小的圖像要使用不同大小的 canvas,使用同一個 canvas 會有些像素清不掉,試用了其他方法清除:沒有起到效果

canvas 方式像素數(shù)據(jù)的原點位置,原點是在左下角

創(chuàng)建內(nèi)核,內(nèi)核里邊的函數(shù)或者自定義函數(shù),在打包過程中被壓縮、簡化處理后會出現(xiàn)問題:被轉(zhuǎn)換后的某些運算符 gpu.js 不支持。所以 js 的壓縮轉(zhuǎn)化規(guī)則要做具體的設(shè)置

因為每個設(shè)備的 gpu 特性不一樣,使用 gpujs 庫可能有未知異常,總之加上 try { } catch () { 普通處理 cpu } 能解決大多數(shù)問題。

  1. # 在 index.html 中引入 gpu.js 
  2. <script type="text/javascript" src="./static/gpu-browser.min.js"></script> 
  3. # 開始使用 
  4. var  gpu = new GPU(); 
  5. gpu.addFunction(function1) # 添加自定義函數(shù) 
  6. gpu.addFunction(function12) # 添加自定義函數(shù) 
  7. # 創(chuàng)建 Kernel 
  8. var kernel =  gpu.createKernel(function(參數(shù) 1,參數(shù) 2,...) { 
  9.     # 調(diào)窗實現(xiàn)算法 
  10.     # 
  11.     # 
  12.     # 
  13. }, 
  14. {   
  15.   graphical: true
  16.   output: outputsize 
  17. }) 
  18. # 執(zhí)行 Kernel 
  19. kernel(入?yún)?shù) 1,入?yún)?shù) 2,...); 
  20. var canvasRender = kernel.canvas; 
  21. # 直接顯示 canvasRender, .... 

官方使用場景 demo

地址:https://gpu.rocks/#/examples

An example with the shiny new v2 of GPU.js, "Cosmic Jellyfish"

A simple example to load an image into GPU.js.

GPU Accelerated Heatmap using GPU.js

A simple example wherein colors slowly fade in and fade out.

Browser

  1. <script src="dist/gpu-browser.min.js"></script> 
  2. <script> 
  3.     // GPU is a constructor and namespace for browser 
  4.     const gpu = new GPU(); 
  5.     const multiplyMatrix = gpu.createKernel(function(a, b) { 
  6.         let sum = 0; 
  7.         for (let i = 0; i < 512; i++) { 
  8.             sum += a[this.thread.y][i] * b[i][this.thread.x]; 
  9.         } 
  10.         return sum
  11.     }).setOutput([512, 512]); 
  12.     const c = multiplyMatrix(a, b); 
  13. </script> 

 

 

Node

  1. const { GPU } = require('gpu.js'); 
  2. const gpu = new GPU(); 
  3. const multiplyMatrix = gpu.createKernel(function(a, b) { 
  4.     let sum = 0; 
  5.     for (let i = 0; i < 512; i++) { 
  6.         sum += a[this.thread.y][i] * b[i][this.thread.x]; 
  7.     } 
  8.     return sum
  9. }).setOutput([512, 512]); 
  10.  
  11. const c = multiplyMatrix(a, b); 

示例

在本例中,兩個 512x512 矩陣(二維數(shù)組)相乘。計算是在 GPU 上并行完成的。

1.生成矩陣

  1. const generateMatrices = () => { 
  2.    const matrices = [[], []] 
  3.    for (let y = 0; y < 512; y++){ 
  4.      matrices[0].push([]) 
  5.      matrices[1].push([]) 
  6.      for (let x = 0; x < 512; x++){ 
  7.        matrices[0][y].push(Math.random()) 
  8.        matrices[1][y].push(Math.random()) 
  9.      } 
  10.    } 
  11.    return matrices 
  12.  } 

2.創(chuàng)建“內(nèi)核”

  1. const gpu = new GPU(); 
  2.  const multiplyMatrix = gpu.createKernel(function(a, b) { 
  3.    let sum = 0; 
  4.    for (let i = 0; i < 512; i++) { 
  5.      sum += a[this.thread.y][i] * b[i][this.thread.x]; 
  6.    } 
  7.    return sum
  8.  }).setOutput([512, 512]) 

3.以矩陣為參數(shù)調(diào)用內(nèi)核

  1. const matrices = generateMatrices() 
  2. const out = multiplyMatrix(matrices[0], matrices[1]) 

4.輸出矩陣

console.log(out[y][x]) // Logs the element at the xth row and the yth column of the matrix

console.log(out[10][12]) // Logs the element at the 10th row and the 12th column of the output matri

小結(jié)

gpu.js 是在前端將 js 的一個子集編譯成能在 webgl 上執(zhí)行的一個編譯器,簡單、實用,能快速出結(jié)果,在對性能要求高、又耗時的運算可以考慮使用 gpu.js 來實現(xiàn)。

參考資料

官網(wǎng) https://gpu.rocks/#/

github https://github.com/gpujs/gpu.js

 

更多例子 https://gpu.rocks/#/examples

楊廣: 微醫(yī)前端技術(shù)部前端工程師。有志成為一名全棧開發(fā)工程師甚至架構(gòu)師,路漫漫,吾求索。生活中通過健身釋放壓力,思考問題。

 

責(zé)任編輯:武曉燕 來源: 微醫(yī)大前端技術(shù)
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