KNN中不同距離度量對(duì)比和介紹
k近鄰算法KNN是一種簡(jiǎn)單而強(qiáng)大的算法,可用于分類和回歸任務(wù)。他實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單,主要依賴不同的距離度量來(lái)判斷向量間的區(qū)別,但是有很多距離度量可以使用,所以本文演示了KNN與三種不同距離度量(Euclidean、Minkowski和Manhattan)的使用。
KNN算法概述
KNN是一種惰性、基于實(shí)例的算法。它的工作原理是將新樣本的特征與數(shù)據(jù)集中現(xiàn)有樣本的特征進(jìn)行比較。然后算法選擇最接近的k個(gè)樣本,其中k是用戶定義的參數(shù)。新樣本的輸出是基于“k”最近樣本的多數(shù)類(用于分類)或平均值(用于回歸)確定的。
有很多距離度量的算法,我們這里選取3個(gè)最常用度量的算法來(lái)進(jìn)行演示:
1、歐氏距離 Euclidean Distance
def euclidean_distance(x1, x2):
return math.sqrt(np.sum((x1 - x2)**2))
euclidean_distance函數(shù)計(jì)算多維空間中兩點(diǎn)(x1和x2)之間的歐氏距離,函數(shù)的工作原理如下:
- 從x1元素中減去x2,得到對(duì)應(yīng)坐標(biāo)之間的差值。
- 使用**2運(yùn)算將差值平方。
- 使用np.sum()對(duì)差的平方求和。
- 使用math.sqrt()取總和的平方根。
歐幾里得距離是歐幾里得空間中兩點(diǎn)之間的直線距離。通過(guò)計(jì)算歐幾里得距離,可以識(shí)別給定樣本的最近鄰居,并根據(jù)鄰居的多數(shù)類(用于分類)或平均值(用于回歸)進(jìn)行預(yù)測(cè)。在處理連續(xù)的實(shí)值特征時(shí),使用歐幾里得距離很有幫助,因?yàn)樗峁┝艘环N直觀的相似性度量。
2、曼哈頓距離 Manhattan Distance
兩點(diǎn)坐標(biāo)的絕對(duì)差值之和。
def manhattan_distance(x1, x2):
return np.sum(np.abs(x1 - x2))
Manhattan _distance函數(shù)計(jì)算多維空間中兩點(diǎn)(x1和x2)之間的曼哈頓距離,函數(shù)的工作原理如下:
- 用np計(jì)算x1和x2對(duì)應(yīng)坐標(biāo)的絕對(duì)差值。Abs (x1 - x2)
- 使用np.sum()對(duì)絕對(duì)差進(jìn)行求和。
曼哈頓距離,也稱為L(zhǎng)1距離或出租車距離,是兩點(diǎn)坐標(biāo)的絕對(duì)差值之和。它代表了當(dāng)運(yùn)動(dòng)被限制為網(wǎng)格狀結(jié)構(gòu)時(shí),點(diǎn)之間的最短路徑,類似于在城市街道上行駛的出租車。
在數(shù)據(jù)特征具有不同尺度的情況下,或者當(dāng)問(wèn)題域的網(wǎng)格狀結(jié)構(gòu)使其成為更合適的相似性度量時(shí),使用曼哈頓距離可能會(huì)有所幫助。曼哈頓距離可以根據(jù)樣本的特征來(lái)衡量樣本之間的相似性或差異性。
與歐幾里得距離相比,曼哈頓距離對(duì)異常值的敏感性較低,因?yàn)樗鼪](méi)有對(duì)差異進(jìn)行平方。這可以使它更適合于某些數(shù)據(jù)集或異常值的存在可能對(duì)模型的性能產(chǎn)生重大影響的問(wèn)題。
3、閔可夫斯基距離 Minkowski Distance
它是歐幾里得距離和曼哈頓距離的一般化的表現(xiàn)形式,使用p進(jìn)行參數(shù)化。當(dāng)p=2時(shí),它變成歐氏距離,當(dāng)p=1時(shí),它變成曼哈頓距離。
def minkowski_distance(x1, x2, p):
return np.power(np.sum(np.power(np.abs(x1 - x2), p)), 1/p)
minkowski_distance函數(shù)計(jì)算多維空間中兩點(diǎn)(x1和x2)之間的閔可夫斯基距離。
當(dāng)你想要控制單個(gè)特征的差異對(duì)整體距離的影響時(shí),使用閔可夫斯基距離會(huì)很有幫助。通過(guò)改變p值,可以調(diào)整距離度量對(duì)特征值或大或小差異的靈敏度,使其更適合特定的問(wèn)題域或數(shù)據(jù)集。
閔可夫斯基距離可以根據(jù)樣本的特征來(lái)衡量樣本之間的相似性或不相似性。該算法通過(guò)計(jì)算適當(dāng)p值的閔可夫斯基距離,識(shí)別出給定樣本的最近鄰居,并根據(jù)鄰居的多數(shù)類(用于分類)或平均值(用于回歸)進(jìn)行預(yù)測(cè)。
KNN 算法的代碼實(shí)現(xiàn)
因?yàn)镵NN算法的原理很簡(jiǎn)單,所以我們這里直接使用Python實(shí)現(xiàn),這樣也可以對(duì)算法有一個(gè)更好的理解:
def knn_euclidean_distance(X_train, y_train, X_test, k):
# List to store the predicted labels for the test set
y_pred = []
# Iterate over each point in the test set
for i in range(len(X_test)):
distances = []
# Iterate over each point in the training set
for j in range(len(X_train)):
# Calculate the distance between the two points using the Euclidean distance metric
dist = euclidean_distance(X_test[i], X_train[j])
distances.append((dist, y_train[j]))
# Sort the distances list by distance (ascending order)
distances.sort()
# Get the k nearest neighbors
neighbors = distances[:k]
# Count the votes for each class
counts = {}
for neighbor in neighbors:
label = neighbor[1]
if label in counts:
counts[label] += 1
else:
counts[label] = 1
# Get the class with the most votes
max_count = max(counts, key=counts.get)
y_pred.append(max_count)
return y_pred
這個(gè)' knn_euclidean_distance '函數(shù)對(duì)于解決分類問(wèn)題很有用,因?yàn)樗梢愿鶕?jù)' k '個(gè)最近鄰居中的大多數(shù)類進(jìn)行預(yù)測(cè)。該函數(shù)使用歐幾里得距離作為相似性度量,可以識(shí)別測(cè)試集中每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的最近鄰居,并相應(yīng)地預(yù)測(cè)它們的標(biāo)簽。我們實(shí)現(xiàn)的代碼提供了一種顯式的方法來(lái)計(jì)算距離、選擇鄰居,并根據(jù)鄰居的投票做出預(yù)測(cè)。
在使用曼哈頓距離時(shí),KNN算法與歐氏距離保持一致,只需要將距離計(jì)算函數(shù)euclidean_distance修改為manhattan_distance。而閔可夫斯基距離則需要多加一個(gè)參數(shù)p,實(shí)現(xiàn)代碼如下:
def knn_minkowski_distance(X_train, y_train, X_test, k, p):
# List to store the predicted labels for the test set
y_pred = []
# Iterate over each point in the test set
for i in range(len(X_test)):
distances = []
# Iterate over each point in the training set
for j in range(len(X_train)):
# Calculate the distance between the two points using the Minkowski distance metric
dist = minkowski_distance(X_test[i], X_train[j], p)
distances.append((dist, y_train[j]))
# Sort the distances list by distance (ascending order)
distances.sort()
# Get the k nearest neighbors
neighbors = distances[:k]
# Count the votes for each class
counts = {}
for neighbor in neighbors:
label = neighbor[1]
if label in counts:
counts[label] += 1
else:
counts[label] = 1
# Get the class with the most votes
max_count = max(counts, key=counts.get)
y_pred.append(max_count)
return y_pred
距離度量對(duì)比
我使用的數(shù)據(jù)集是乳腺癌數(shù)據(jù)集,可以在kaggle上直接下載
這個(gè)數(shù)據(jù)集是機(jī)器學(xué)習(xí)和數(shù)據(jù)挖掘中廣泛使用的基準(zhǔn)數(shù)據(jù)集,用于二元分類任務(wù)。它是由威廉·h·沃爾伯格(William H. Wolberg)博士及其合作者在20世紀(jì)90年代從麥迪遜的威斯康星大學(xué)醫(yī)院收集的。該數(shù)據(jù)集可通過(guò)UCI機(jī)器學(xué)習(xí)存儲(chǔ)庫(kù)公開(kāi)獲取。
Breast Cancer Wisconsin數(shù)據(jù)集包含569個(gè)實(shí)例,每個(gè)實(shí)例有32個(gè)屬性。這些屬性是:
ID number:每個(gè)樣本的唯一標(biāo)識(shí)符。
Diagnosis:目標(biāo)變量有兩個(gè)可能的值——“M”(惡性)和“B”(良性)。
剩下的是30個(gè)從乳腺腫塊的細(xì)針抽吸(FNA)的數(shù)字化圖像中計(jì)算出來(lái)的特征。它們描述了圖像中細(xì)胞核的特征。對(duì)每個(gè)細(xì)胞核計(jì)算每個(gè)特征,然后求平均值,得到10個(gè)實(shí)值特征:
- Radius:從中心到周邊點(diǎn)的平均距離。
- Texture:灰度值的標(biāo)準(zhǔn)偏差。
- Perimeter:細(xì)胞核的周長(zhǎng)。
- Area:細(xì)胞核的面積。
- Smoothness:半徑長(zhǎng)度的局部變化。
- Compactness:周長(zhǎng)2/面積- 1.0。
- Concavity:輪廓中凹部分的嚴(yán)重程度。
- Concave points:輪廓的凹部分的數(shù)目。
- Symmetry:細(xì)胞核的對(duì)稱性。
- Fractal dimension:“Coastline approximation”- 1
對(duì)每張圖像計(jì)算這十個(gè)特征的平均值、標(biāo)準(zhǔn)誤差和最小或最大值(三個(gè)最大值的平均值),總共得到30個(gè)特征。數(shù)據(jù)集不包含任何缺失的屬性值。
由于數(shù)據(jù)集包含30個(gè)特征,我們需要對(duì)數(shù)據(jù)集進(jìn)行特征選擇。這種方法的主要目的是通過(guò)選擇與目標(biāo)變量具有強(qiáng)線性關(guān)系的較小的特征子集來(lái)降低數(shù)據(jù)集的維數(shù)。通過(guò)選擇高相關(guān)性的特征,目的是保持模型的預(yù)測(cè)能力,同時(shí)減少使用的特征數(shù)量,潛在地提高模型的性能和可解釋性。這里需要注意的是,該方法只考慮特征與目標(biāo)變量之間的線性關(guān)系,如果底層關(guān)系是非線性的,或者特征之間存在重要的交互作用,則該方法可能無(wú)效。
讀取數(shù)據(jù)并計(jì)算相關(guān)系數(shù):
df = pd.read_csv('/kaggle/input/breast-cancer-wisconsin-data/data.csv')
corr = df.corr()
corr_threshold = 0.6
selected_features = corr.index[np.abs(corr['diagnosis']) >= corr_threshold]
new_cancer_data = df[selected_features]
訓(xùn)練代碼:
X_train_np = np.array(X_train)
X_test_np = np.array(X_test)
# Convert y_train and y_test to numpy arrays
y_train_np = np.array(y_train)
y_test_np = np.array(y_test)
k_values = list(range(1, 15))
accuracies = []
for k in k_values:
y_pred = knn_euclidean_distance(X_train_np, y_train_np, X_test_np, k)
accuracy = accuracy_score(y_test_np, y_pred)
accuracies.append(accuracy)
# Create a data frame to store k values and accuracies
results_df = pd.DataFrame({'k': k_values, 'Accuracy': accuracies})
# Create the interactive plot using Plotly
fig = px.line(results_df, x='k', y='Accuracy', title='KNN Accuracy for Different k Values', labels={'k': 'k', 'Accuracy': 'Accuracy'})
fig.show()
# Get the best k value
best_k = k_values[accuracies.index(max(accuracies))]
best_accuracy = max(accuracies)
print("Best k value is:", best_k , "where accuracy is:" ,best_accuracy)
上面代碼使用歐幾里得距離將KNN算法應(yīng)用于分類問(wèn)題,同時(shí)改變鄰居的數(shù)量(k)以找到最高精度的最佳k值。它使用訓(xùn)練集(X_train_np和y_train_np)來(lái)訓(xùn)練模型,使用測(cè)試集(X_test_np和y_test_np)來(lái)進(jìn)行預(yù)測(cè)和評(píng)估模型的性能。
k是KNN算法的一個(gè)超參數(shù),選擇正確的k值對(duì)于實(shí)現(xiàn)最佳模型性能至關(guān)重要,因?yàn)閗值太小可能導(dǎo)致過(guò)擬合,而k值太大可能導(dǎo)致欠擬合。通過(guò)可視化k值與其對(duì)應(yīng)的精度之間的關(guān)系,可以深入了解模型的性能,并為問(wèn)題選擇最合適的k值。
閔可夫斯基距離的代碼修改如下:
# Run the KNN algorithm on the test set for different k and p values
k_values = list(range(1, 15))
p_values = list(range(1, 6))
results = []
for k in k_values:
for p in p_values:
y_pred = knn_minkowski_distance(X_train_np, y_train_np, X_test_np, k, p)
accuracy = accuracy_score(y_test_np, y_pred)
results.append((k, p, accuracy))
# Create a data frame to store k, p values, and accuracies
results_df = pd.DataFrame(results, columns=['k', 'p', 'Accuracy'])
# Create the 3D plot using Plotly
fig = go.Figure(data=[go.Scatter3d(
x=results_df['k'],
y=results_df['p'],
z=results_df['Accuracy'],
mode='markers',
marker=dict(
size=4,
color=results_df['Accuracy'],
colorscale='Viridis',
showscale=True,
opacity=0.8
),
text=[f"k={k}, p={p}, Acc={acc:.2f}" for k, p, acc in results]
)])
fig.update_layout(scene=dict(
xaxis_title='k',
yaxis_title='p',
zaxis_title='Accuracy'
))
fig.show()
為了進(jìn)一步改善我們的結(jié)果,我們還可以數(shù)據(jù)集進(jìn)行縮放。應(yīng)用特征縮放的主要目的是確保所有特征具有相同的尺度,這有助于提高基于距離的算法(如KNN)的性能。在KNN算法中,數(shù)據(jù)點(diǎn)之間的距離對(duì)確定它們的相似度起著至關(guān)重要的作用。如果特征具有不同的尺度,則算法可能會(huì)更加重視尺度較大的特征,從而導(dǎo)致次優(yōu)預(yù)測(cè)。通過(guò)將特征縮放到均值和單位方差為零,算法可以平等地對(duì)待所有特征,從而獲得更好的模型性能。
本文將使用StandardScaler()和MinMaxScaler()來(lái)擴(kuò)展我們的數(shù)據(jù)集。StandardScaler和MinMaxScaler是機(jī)器學(xué)習(xí)中兩種流行的特征縮放技術(shù)。這兩種技術(shù)都用于將特征轉(zhuǎn)換為公共尺度,這有助于提高許多機(jī)器學(xué)習(xí)算法的性能,特別是那些依賴于距離的算法,如KNN或支持向量機(jī)(SVM)。
使用不同的尺度和不同的距離函數(shù)訓(xùn)練KNN,可以進(jìn)行比較并選擇最適合數(shù)據(jù)集的技術(shù)。我們得到了以下結(jié)果:
可以使用柱狀圖表示來(lái)更好地分析和理解這些結(jié)果。
總結(jié)
根據(jù)上面的結(jié)果,我們可以得到以下的結(jié)論:
在不進(jìn)行特征縮放時(shí),歐幾里得距離和閔可夫斯基距離都達(dá)到了0.982456的最高精度。
曼哈頓離在所有情況下的精度都比較低,這表明歐幾里得或閔可夫斯基距離可能更適合這個(gè)問(wèn)題。當(dāng)閔可夫斯基距離度量中的p值為2時(shí),它等于歐幾里得距離。在我們這個(gè)實(shí)驗(yàn)中這兩個(gè)指標(biāo)的結(jié)果是相同的,也證明了這是正確的。
對(duì)于歐幾里得和閔可夫斯基距離度量,不應(yīng)用任何特征縮放就可以獲得最高的精度。而對(duì)于曼哈頓距離,與非縮放數(shù)據(jù)相比,StandardScaler和MinMaxScaler都提高了模型的性能。這表明特征縮放的影響取決于所使用的距離度量。
最佳k值:最佳k值取決于距離度量和特征縮放技術(shù)。例如,k=11是不應(yīng)用縮放并且使用歐幾里得距離或閔可夫斯基距離時(shí)的最佳值,而k=9是使用曼哈頓距離時(shí)的最佳值。當(dāng)應(yīng)用特征縮放時(shí),最佳k值通常較低,范圍在3到11之間。
最后,該問(wèn)題的最佳KNN模型使用歐式距離度量,無(wú)需任何特征縮放,在k=11個(gè)鄰居時(shí)達(dá)到0.982456的精度。這應(yīng)該是我們這個(gè)數(shù)據(jù)集在使用KNN時(shí)的最佳解。