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五種被低估的非常規(guī)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法:數(shù)學(xué)原理剖析與多領(lǐng)域應(yīng)用價(jià)值研究

大數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)分析
本文將詳細(xì)介紹五種具有重要應(yīng)用價(jià)值的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法,并探討它們?cè)诿庖邔W(xué)(TCR/BCR庫(kù)分析)、金融數(shù)據(jù)分析和運(yùn)動(dòng)科學(xué)等領(lǐng)域的具體應(yīng)用。

在當(dāng)前的數(shù)據(jù)分析實(shí)踐中,研究人員往往過(guò)度依賴t檢驗(yàn)和方差分析(ANOVA)等傳統(tǒng)統(tǒng)計(jì)方法。但是還存在多種具有重要應(yīng)用價(jià)值但未受到足夠重視的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法,這些方法在處理復(fù)雜的實(shí)際數(shù)據(jù)時(shí)具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。本文將詳細(xì)介紹五種具有重要應(yīng)用價(jià)值的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法,并探討它們?cè)诿庖邔W(xué)(TCR/BCR庫(kù)分析)、金融數(shù)據(jù)分析和運(yùn)動(dòng)科學(xué)等領(lǐng)域的具體應(yīng)用。

1、Mann-Kendall趨勢(shì)檢驗(yàn)

Mann-Kendall檢驗(yàn)是一種非參數(shù)檢驗(yàn)方法,用于檢測(cè)時(shí)間序列中是否存在單調(diào)上升或下降趨勢(shì)。與傳統(tǒng)線性回歸相比,該方法的優(yōu)勢(shì)在于不要求數(shù)據(jù)滿足線性關(guān)系假設(shè)或服從正態(tài)分布。

應(yīng)用價(jià)值

  • 金融領(lǐng)域:用于檢測(cè)股票價(jià)格的潛在趨勢(shì)變化,特別適用于非線性市場(chǎng)環(huán)境。
  • 免疫學(xué)研究:監(jiān)測(cè)TCR/BCR克隆群體隨時(shí)間的動(dòng)態(tài)變化趨勢(shì)。

為了展示Mann-Kendall檢驗(yàn)的應(yīng)用效果,我們構(gòu)建了兩組對(duì)照數(shù)據(jù):

  1. 具有上升趨勢(shì)的時(shí)間序列:數(shù)據(jù)呈現(xiàn)明確的時(shí)間依賴性增長(zhǎng)特征。
  2. 無(wú)趨勢(shì)隨機(jī)序列:數(shù)據(jù)表現(xiàn)為圍繞均值的隨機(jī)波動(dòng)(白噪聲過(guò)程)。

以下代碼實(shí)現(xiàn)了這兩種情況的數(shù)據(jù)生成和分析過(guò)程:

import pymannkendall as mk  
 np.random.seed(43)  
   
 # 1. 生成具有上升趨勢(shì)的時(shí)間序列  
 time_trend = np.arange(1, 31)  
 values_trend = 0.5 * time_trend + np.random.normal(0, 2, size=len(time_trend))  
   
 # 2. 生成無(wú)趨勢(shì)隨機(jī)序列  
 time_no_trend = np.arange(1, 31)  
 values_no_trend = np.random.normal(0, 2, size=len(time_no_trend))  
   
 # 執(zhí)行Mann-Kendall趨勢(shì)檢驗(yàn)  
 trend_result = mk.original_test(values_trend)  
 no_trend_result = mk.original_test(values_no_trend)  
   
 fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(20, 10))  
 plt.grid(lw=2, ls=':')  
   
 axes[0].plot(time_trend, values_trend, marker='o', linestyle='-', color='blue')  
 axes[0].set_title("Data with Upward Trend")  
 axes[0].set_xlabel("Time")  
 axes[0].set_ylabel("Value")  
   
 textstr_trend = '\n'.join((  
     f"Trend: {trend_result.trend}",  
     f"P-value: {trend_result.p:.5f}",  
     f"Tau (Kendall's): {trend_result.Tau:.4f}"  
 ))  
 props = dict(boxstyle='round', facecolor='wheat', alpha=0.5)  
 axes[0].text(0.05, 0.95, textstr_trend, transform=axes[0].transAxes, fontsize=14,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 axes[1].plot(time_no_trend, values_no_trend, marker='o', linestyle='-', color='red')  
 axes[1].set_title("Data with No Trend")  
 axes[1].set_xlabel("Time")  
 axes[1].set_ylabel("Value")  
 axes[1].grid(lw=2, ls=':')  
 axes[0].grid(lw=2, ls=':')  
   
 textstr_no_trend = '\n'.join((  
     f"Trend: {no_trend_result.trend}",  
     f"P-value: {no_trend_result.p:.5f}",  
     f"Tau (Kendall's): {no_trend_result.Tau:.4f}"  
 ))  
 axes[1].text(0.05, 0.95, textstr_no_trend, transform=axes[1].transAxes, fontsize=14,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 plt.tight_layout()  
 plt.grid(lw=2, ls=':')  
 plt.show()

實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析:

上升趨勢(shì)序列:檢驗(yàn)結(jié)果顯示"increasing"(上升趨勢(shì)),且p值較低,具有統(tǒng)計(jì)顯著性。

無(wú)趨勢(shì)序列:檢驗(yàn)結(jié)果顯示"no trend"(無(wú)趨勢(shì)),p值較高,未能拒絕無(wú)趨勢(shì)的原假設(shè)。

2、Mood中位數(shù)檢驗(yàn)

Mood中位數(shù)檢驗(yàn)是一種穩(wěn)健的非參數(shù)統(tǒng)計(jì)方法,用于檢驗(yàn)多個(gè)獨(dú)立樣本是否來(lái)自具有相同中位數(shù)的總體。該方法在處理偏態(tài)分布數(shù)據(jù)時(shí)具有特殊優(yōu)勢(shì),尤其適用于研究重點(diǎn)關(guān)注中位數(shù)而非均值的場(chǎng)景。

方法應(yīng)用領(lǐng)域:

  • 免疫學(xué)研究:用于比較不同患者群體間的TCR多樣性指標(biāo)中位數(shù)(如比較不同免疫庫(kù)間的K1000指數(shù))。
  • 金融數(shù)據(jù)分析:評(píng)估不同金融資產(chǎn)的日收益率中位數(shù)差異。
  • 運(yùn)動(dòng)科學(xué)研究:分析不同訓(xùn)練方案下運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)指標(biāo)的中位數(shù)差異。

實(shí)證研究設(shè)計(jì)

為驗(yàn)證Mood中位數(shù)檢驗(yàn)的效能,我們?cè)O(shè)計(jì)了兩組對(duì)照實(shí)驗(yàn):

中位數(shù)顯著差異組:構(gòu)造具有明顯中位數(shù)差異的兩個(gè)樣本組。

中位數(shù)相近組:構(gòu)造具有相似中位數(shù)的兩個(gè)樣本組。

實(shí)驗(yàn)代碼實(shí)現(xiàn)如下:

import numpy as np  
 from scipy.stats import median_test  
 import matplotlib.pyplot as plt  
   
 np.random.seed(2024)  
   
 # 構(gòu)造具有顯著差異的樣本組  
 group_A_diff = np.random.exponential(scale=1.0, size=50)  
 group_B_diff = np.random.exponential(scale=2.0, size=50)  
   
 # 構(gòu)造中位數(shù)相近的樣本組  
 group_A_sim = np.random.exponential(scale=1.0, size=50)  
 group_B_sim = np.random.exponential(scale=1.1, size=50)  
   
 # 應(yīng)用Mood中位數(shù)檢驗(yàn)  
 stat_diff, p_value_diff, median_diff, table_diff = median_test(group_A_diff, group_B_diff)  
 stat_sim, p_value_sim, median_sim, table_sim = median_test(group_A_sim, group_B_sim)  
   
 fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(20, 7))  
   
 axes[0].boxplot([group_A_diff, group_B_diff], labels=["Group A (diff)", "Group B (diff)"])  
 axes[0].set_title("Groups with Different Medians")  
 axes[0].set_ylabel("Value")  
   
 textstr_diff = '\n'.join((  
     f"Test Statistic: {stat_diff:.4f}",  
     f"P-value: {p_value_diff:.5f}",  
     f"Overall Median: {median_diff:.4f}",  
     f"Contingency Table:\n{table_diff}"  
 ))  
 props = dict(boxstyle='round', facecolor='wheat', alpha=0.5)  
 axes[0].text(0.05, 0.95, textstr_diff, transform=axes[0].transAxes, fontsize=10,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 axes[1].boxplot([group_A_sim, group_B_sim], labels=["Group A (sim)", "Group B (sim)"])  
 axes[1].set_title("Groups with Similar Medians")  
 axes[1].set_ylabel("Value")  
   
 textstr_sim = '\n'.join((  
     f"Test Statistic: {stat_sim:.4f}",  
     f"P-value: {p_value_sim:.5f}",  
     f"Overall Median: {median_sim:.4f}",  
     f"Contingency Table:\n{table_sim}"  
 ))  
 axes[1].text(0.05, 0.95, textstr_sim, transform=axes[1].transAxes, fontsize=10,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 axes[1].grid(lw=2, ls=':', axis='y')  
 axes[0].grid(lw=2, ls=':', axis='y')  
   
 plt.tight_layout()  
 plt.show()

3、 Friedman檢驗(yàn)

Friedman檢驗(yàn)是重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)中的非參數(shù)檢驗(yàn)方法,其作用等同于參數(shù)檢驗(yàn)中的重復(fù)測(cè)量方差分析。該方法主要用于評(píng)估在相同實(shí)驗(yàn)單元(或區(qū)組)上實(shí)施多種處理時(shí),不同處理之間是否存在顯著差異。

應(yīng)用場(chǎng)景分析:

運(yùn)動(dòng)科學(xué)研究:評(píng)估同一組運(yùn)動(dòng)員在不同訓(xùn)練方案下的長(zhǎng)期表現(xiàn)變化。

免疫學(xué)研究:分析同一患者群體在不同治療方案下或不同時(shí)間點(diǎn)的免疫應(yīng)答變化。

金融分析:在多個(gè)時(shí)間窗口內(nèi)對(duì)比評(píng)估同一時(shí)間序列數(shù)據(jù)的不同預(yù)測(cè)模型性能。

實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)包含兩種對(duì)照情況:

顯著差異情況:三種處理方法產(chǎn)生統(tǒng)計(jì)上顯著不同的效果。

無(wú)顯著差異情況:三種處理方法產(chǎn)生統(tǒng)計(jì)上相似的效果。

實(shí)驗(yàn)代碼實(shí)現(xiàn):

import numpy as np  
 from scipy.stats import friedmanchisquare  
 import matplotlib.pyplot as plt  
   
 np.random.seed(456)  
   
 # 構(gòu)造顯著差異數(shù)據(jù)  
 method_A1 = np.random.normal(loc=50, scale=5, size=10)  
 method_B1 = np.random.normal(loc=60, scale=5, size=10)  
 method_C1 = np.random.normal(loc=70, scale=5, size=10)  
 stat1, pval1 = friedmanchisquare(method_A1, method_B1, method_C1)  
   
 # 構(gòu)造無(wú)顯著差異數(shù)據(jù)  
 method_A2 = np.random.normal(loc=50, scale=5, size=10)  
 method_B2 = np.random.normal(loc=51, scale=5, size=10)  
 method_C2 = np.random.normal(loc=49.5, scale=5, size=10)  
 stat2, pval2 = friedmanchisquare(method_A2, method_B2, method_C2)  
   
 fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(20, 7))  
   
 axes[0].boxplot([method_A1, method_B1, method_C1], labels=["A", "B", "C"])  
 axes[0].set_title("Scenario 1: Significant Difference")  
 textstr1 = f"Test statistic: {stat1:.4f}\nP-value: {pval1:.4f}"  
 props = dict(boxstyle='square', facecolor='wheat', alpha=0.5)  
 axes[0].text(0.05, 0.95, textstr1, transform=axes[0].transAxes, fontsize=10,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 axes[1].boxplot([method_A2, method_B2, method_C2], labels=["A", "B", "C"])  
 axes[1].set_title("Scenario 2: No Significant Difference")  
 textstr2 = f"Test statistic: {stat2:.4f}\nP-value: {pval2:.4f}"  
 axes[1].text(0.05, 0.95, textstr2, transform=axes[1].transAxes, fontsize=10,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 axes[0].grid(lw=2, ls=':', axis='y')  
 axes[1].grid(lw=2, ls=':', axis='y')  
   
 plt.tight_layout()  
 plt.show()

實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析:

  • 顯著差異組:檢驗(yàn)結(jié)果表明組間存在統(tǒng)計(jì)顯著性差異,體現(xiàn)為較低的p值和明顯的中位數(shù)差異。
  • 無(wú)顯著差異組:數(shù)據(jù)分布呈現(xiàn)大量重疊,p值較高,未能拒絕無(wú)差異的原假設(shè)。

4、Theil-Sen估計(jì)方法

Theil-Sen估計(jì)器是一種用于線性關(guān)系估計(jì)的穩(wěn)健統(tǒng)計(jì)方法。與傳統(tǒng)最小二乘法(OLS)相比,該方法基于所有數(shù)據(jù)點(diǎn)對(duì)之間斜率的中位數(shù)進(jìn)行估計(jì),因此對(duì)異常值具有較強(qiáng)的抗干擾能力。

主要應(yīng)用領(lǐng)域:

  • 金融數(shù)據(jù)分析:在存在市場(chǎng)異常波動(dòng)的情況下估計(jì)資產(chǎn)價(jià)格趨勢(shì)。
  • 免疫學(xué)研究:分析TCR頻率或抗體水平的時(shí)間序列變化趨勢(shì),即使存在個(gè)別異常測(cè)量值。
  • 運(yùn)動(dòng)科學(xué)研究:在剔除極端表現(xiàn)影響的情況下評(píng)估運(yùn)動(dòng)員的進(jìn)步趨勢(shì)。

方法驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)

實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)包含兩種典型場(chǎng)景:

常規(guī)數(shù)據(jù)場(chǎng)景:數(shù)據(jù)點(diǎn)呈現(xiàn)規(guī)律的線性關(guān)系。

異常值場(chǎng)景:數(shù)據(jù)中包含顯著偏離主要趨勢(shì)的異常觀測(cè)值。

實(shí)驗(yàn)代碼實(shí)現(xiàn):

import numpy as np  
 import matplotlib.pyplot as plt  
 from sklearn.linear_model import LinearRegression, TheilSenRegressor  
   
 np.random.seed(789)  
 X = np.linspace(0, 10, 50)  
 y = 3 * X + np.random.normal(0, 1, 50)  
   
 # 構(gòu)造常規(guī)數(shù)據(jù)場(chǎng)景  
 X1 = X.reshape(-1, 1)  
 y1 = y.copy()  
 lr1 = LinearRegression().fit(X1, y1)  
 ts1 = TheilSenRegressor().fit(X1, y1)  
   
 y_pred_lr1 = lr1.predict(X1)  
 y_pred_ts1 = ts1.predict(X1)  
   
 # 構(gòu)造異常值場(chǎng)景  
 X2 = X.reshape(-1, 1)  
 y2 = y.copy()  
 y2[10] += 20   # 引入正向異常值  
 y2[25] -= 15   # 引入負(fù)向異常值  
 lr2 = LinearRegression().fit(X2, y2)  
 ts2 = TheilSenRegressor().fit(X2, y2)  
   
 y_pred_lr2 = lr2.predict(X2)  
 y_pred_ts2 = ts2.predict(X2)  
   
 fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(20, 10))  
   
 axes[0].scatter(X1, y1, color='grey', label='Data')  
 axes[0].plot(X1, y_pred_lr1, color='red', label='Linear Regression')  
 axes[0].plot(X1, y_pred_ts1, color='green', label='Theil-Sen')  
 axes[0].set_title("No Outliers")  
 axes[0].set_xlabel("X")  
 axes[0].set_ylabel("Y")  
 axes[0].legend()  
   
 axes[1].scatter(X2, y2, color='grey', label='Data (with outliers)')  
 axes[1].plot(X2, y_pred_lr2, color='red', label='Linear Regression')  
 axes[1].plot(X2, y_pred_ts2, color='green', label='Theil-Sen')  
 axes[1].set_title("With Outliers")  
 axes[1].set_xlabel("X")  
 axes[1].set_ylabel("Y")  
 axes[1].legend()  
   
 axes[0].grid(lw=2, ls=':', axis='both')  
 axes[1].grid(lw=2, ls=':', axis='both')  
   
 plt.tight_layout()  
 plt.show()

實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示了Theil-Sen估計(jì)器在處理異常值時(shí)的優(yōu)越性,特別是在保持整體趨勢(shì)估計(jì)穩(wěn)定性方面表現(xiàn)出明顯優(yōu)勢(shì)。

5、Anderson-Darling檢驗(yàn)

Anderson-Darling檢驗(yàn)是一種高效的擬合優(yōu)度檢驗(yàn)方法,主要用于驗(yàn)證數(shù)據(jù)是否符合特定的理論分布(通常為正態(tài)分布)。該方法的特點(diǎn)是對(duì)分布尾部的偏差具有較高的敏感度,這一特性使其在某些應(yīng)用場(chǎng)景下比傳統(tǒng)的Shapiro-Wilk檢驗(yàn)更具優(yōu)勢(shì)。

應(yīng)用價(jià)值分析:

  • 金融數(shù)據(jù)分析:驗(yàn)證資產(chǎn)收益率分布的正態(tài)性假設(shè),這對(duì)于風(fēng)險(xiǎn)管理和投資決策具有重要意義。
  • 免疫學(xué)研究:評(píng)估TCR/BCR多樣性指標(biāo)的分布特征。
  • 運(yùn)動(dòng)科學(xué)研究:在應(yīng)用參數(shù)統(tǒng)計(jì)方法前驗(yàn)證性能數(shù)據(jù)的分布假設(shè)。

方法驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)

實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)對(duì)比兩種典型情況:

  1. 正態(tài)分布數(shù)據(jù):符合正態(tài)分布假設(shè)的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集。
  2. 非正態(tài)分布數(shù)據(jù):采用指數(shù)分布生成的偏態(tài)數(shù)據(jù)。

實(shí)驗(yàn)代碼實(shí)現(xiàn):

import numpy as np  
 from scipy.stats import anderson  
 import matplotlib.pyplot as plt  
   
 np.random.seed(101)  
   
 # 生成正態(tài)分布數(shù)據(jù)  
 normal_data = np.random.normal(loc=0, scale=1, size=200)  
 result_normal = anderson(normal_data, dist='norm')  
   
 # 生成非正態(tài)分布數(shù)據(jù)(指數(shù)分布)  
 non_normal_data = np.random.exponential(scale=1.0, size=200)  
 result_non_normal = anderson(non_normal_data, dist='norm')  
   
 # 數(shù)據(jù)可視化分析  
 fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(20, 8))  
   
 axes[0].hist(normal_data, bins=20, color='blue', alpha=0.7)  
 axes[0].set_title("Scenario 1: Normal Data")  
   
 textstr_normal = '\n'.join((  
     f"Statistic: {result_normal.statistic:.4f}",  
     "Critical Values / Significance Levels:",  
     *[f" - {sl}% level: CV = {cv:.4f}" for cv, sl in zip(result_normal.critical_values, result_normal.significance_level)]  
 ))  
 props = dict(boxstyle='round', facecolor='wheat', alpha=0.5)  
 axes[0].text(0.05, 0.95, textstr_normal, transform=axes[0].transAxes, fontsize=10,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 axes[1].hist(non_normal_data, bins=20, color='orange', alpha=0.7)  
 axes[1].set_title("Scenario 2: Non-Normal Data")  
   
 textstr_non_normal = '\n'.join((  
     f"Statistic: {result_non_normal.statistic:.4f}",  
     "Critical Values / Significance Levels:",  
     *[f" - {sl}% level: CV = {cv:.4f}" for cv, sl in zip(result_non_normal.critical_values, result_non_normal.significance_level)]  
 ))  
 axes[1].text(0.25, 0.95, textstr_non_normal, transform=axes[1].transAxes, fontsize=10,  
              verticalalignment='top', bbox=props)  
   
 axes[0].grid(lw=2, ls=':', axis='y')  
 axes[1].grid(lw=2, ls=':', axis='y')  
   
 plt.tight_layout()  
 plt.show()

實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析:

  • 正態(tài)分布數(shù)據(jù):檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量低于臨界值,表明數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布假設(shè)。
  • 非正態(tài)分布數(shù)據(jù):檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量顯著高于臨界值,特別是在分布尾部表現(xiàn)出明顯的偏離。

總結(jié)

本文詳細(xì)介紹的五種統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法,雖然在應(yīng)用頻率上不及t檢驗(yàn)或方差分析,但在特定研究場(chǎng)景中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),尤其是在處理非正態(tài)分布、異常值頻現(xiàn)、以及重復(fù)測(cè)量等復(fù)雜數(shù)據(jù)情況時(shí):

  • Mann-Kendall檢驗(yàn):為時(shí)間序列趨勢(shì)分析提供穩(wěn)健的非參數(shù)方法。
  • Mood中位數(shù)檢驗(yàn):在不要求正態(tài)性假設(shè)的情況下實(shí)現(xiàn)多組中位數(shù)的比較。
  • Friedman檢驗(yàn):為重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)提供可靠的非參數(shù)分析方案。
  • Theil-Sen估計(jì):提供對(duì)異常值具有高度穩(wěn)健性的趨勢(shì)估計(jì)方法。
  • Anderson-Darling檢驗(yàn):在驗(yàn)證分布假設(shè)時(shí)提供對(duì)尾部偏差更敏感的檢驗(yàn)方案。

這些方法為研究人員在TCR庫(kù)分析、金融數(shù)據(jù)研究和運(yùn)動(dòng)科學(xué)等領(lǐng)域提供了有力的統(tǒng)計(jì)工具。盡管數(shù)據(jù)分析本質(zhì)上具有挑戰(zhàn)性,但這些方法的合理應(yīng)用可以幫助研究者獲得更可靠的分析結(jié)果。

責(zé)任編輯:華軒 來(lái)源: DeepHub IMBA
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