Nature:你的大腦衰老速度受這64個(gè)基因影響
你的大腦衰老速度,原來(lái)受這64個(gè)基因影響!
事情是這樣的。
根據(jù)Nature最新報(bào)道,科學(xué)家們通過(guò)利用AI模型分析大量腦部掃描和遺傳數(shù)據(jù),確定了64個(gè)影響大腦衰老速度的基因,并指出了13種潛在的抗衰老藥物。
相關(guān)研究發(fā)表在最新一期Science子刊《Science Advances》上。
按照Nature的評(píng)價(jià),這是嘗試確定影響器官衰退遺傳因素這一研究領(lǐng)域里:
迄今為止規(guī)模最大的一次嘗試
都柏林圣三一學(xué)院的神經(jīng)科學(xué)家Agustín Ibá?ez夸贊道:
此項(xiàng)研究意義重大,因?yàn)樗鼈?span>可能為研發(fā)新的大腦抗衰藥物鋪平道路。
具體研究過(guò)程
有越來(lái)越多的證據(jù)表明,大腦衰老與神經(jīng)退行性疾病(認(rèn)知或軀體的功能障礙)和死亡風(fēng)險(xiǎn)的增加有關(guān)。
因此,本研究首先試圖找出導(dǎo)致大腦衰老的因素,然后基于此找出應(yīng)對(duì)之道。
具體而言,科學(xué)家們將BAG(Brain Age Gap,大腦年齡差距)作為大腦衰老的標(biāo)志,這是指大腦預(yù)測(cè)年齡和實(shí)際年齡之間的差距。
通過(guò)分析大量數(shù)據(jù),他們想找出哪些基因造成了人們的BAG差異。
第一步,他們找來(lái)了29097名健康參與者的UKB數(shù)據(jù)集(英國(guó)生物庫(kù)),以此訓(xùn)練了7個(gè)AI模型進(jìn)行腦齡估計(jì)。
這里要補(bǔ)充一下,過(guò)去幾十年,通過(guò)磁共振成像(MRI)和機(jī)器學(xué)習(xí)模型來(lái)估計(jì)大腦年齡的研究不在少數(shù),這些模型使用健康參與者的MRI數(shù)據(jù)和各種監(jiān)督學(xué)習(xí)算法來(lái)訓(xùn)練回歸模型,從而預(yù)測(cè)個(gè)體的大腦年齡。
接下來(lái),他們使用3227名健康和6637名腦部疾病受試者的數(shù)據(jù),以及來(lái)自ADNI、PPMI和IXI的外部MRI數(shù)據(jù)來(lái)進(jìn)行驗(yàn)證。
(ADNI、PPMI和IXI是三個(gè)不同的神經(jīng)科學(xué)研究項(xiàng)目,它們提供了大量的數(shù)據(jù)和資源,用于研究阿爾茨海默病和其他神經(jīng)退行性疾病。)
所使用的評(píng)估指標(biāo)包括MAE(平均絕對(duì)誤差)、MSE(均方誤差)、R2(決定系數(shù))和Pearson R(皮爾遜相關(guān)系數(shù))。
過(guò)程中他們發(fā)現(xiàn),三維視覺(jué)Transformer(3D-ViT)模型在估計(jì)大腦年齡方面優(yōu)于其他模型,于是被用于后續(xù)分析中測(cè)量BAG。
第二步,他們對(duì)31520名健康參與者進(jìn)行了GWAS(Genome-Wide Association Studies,全基因組關(guān)聯(lián)研究),這是一種用于識(shí)別基因組中遺傳變異與特定性狀或疾病之間關(guān)聯(lián)的研究方法。
換句話說(shuō),GWAS在這里被用來(lái)確定與BAG相關(guān)的遺傳變異。
然后他們利用GWAS的結(jié)果來(lái)進(jìn)一步探索BAG的潛在影響。
具體是指,通過(guò)遺傳相關(guān)性和孟德?tīng)栯S機(jī)化(MR,一種基于遺傳變異的因果推斷方法)方法,他們研究了BAG對(duì)18種腦部疾病和8個(gè)表型特征的因果關(guān)系。
盡管大多數(shù)的因果關(guān)系并不顯著,但研究發(fā)現(xiàn)BAG對(duì)智力有顯著的因果影響。
通過(guò)藥物靶點(diǎn)孟德?tīng)栯S機(jī)化、表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)(eQTL,基因表達(dá)水平與特定基因組位置的遺傳變異)及蛋白質(zhì)數(shù)量性狀位點(diǎn)(pQTL,蛋白質(zhì)水平與遺傳變異之間的關(guān)聯(lián))數(shù)據(jù)的共定位分析,研究確定了64個(gè)可藥物治療的基因。
(共定位分析是一種統(tǒng)計(jì)方法,用于檢驗(yàn)兩個(gè)或多個(gè)表型(例如疾病或分子表型)是否由同一區(qū)域的同一個(gè)因果變異位點(diǎn)驅(qū)動(dòng),幫助我們理解遺傳變異如何影響表型。)
他們發(fā)現(xiàn),這些基因在生物學(xué)上的功能與一些特定的生物化學(xué)通路有關(guān)(圖F),包括程序性細(xì)胞死亡、血小板信號(hào)傳導(dǎo)和聚集、細(xì)胞外基質(zhì)組織、血管壁細(xì)胞表面相互作用和凋亡。
換句話說(shuō),一旦針對(duì)這些通路中的關(guān)鍵基因進(jìn)行藥物開(kāi)發(fā),可能有助于調(diào)節(jié)這些過(guò)程,從而對(duì)抗衰老或治療相關(guān)疾病。
其中,MAPT、TNFSF12、GZMB、SIRPB1、GNLY、NMB和C1RL這七個(gè)基因被認(rèn)為是大腦衰老的強(qiáng)因果候選者。
進(jìn)一步的全基因組掃描探索了這些基因與44個(gè)額外特征的關(guān)聯(lián),再次驗(yàn)證了這些靶點(diǎn)的合理性。
還發(fā)現(xiàn)了466種潛在抗衰藥物
接下來(lái),研究進(jìn)行了藥物再利用分析。
具體而言,他們利用藥物-基因相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)DGIdb,發(fā)現(xiàn)有466種藥物具備抗衰潛力,這些藥物針對(duì)的是64個(gè)已鑒定基因中的29個(gè),這些藥物要么已經(jīng)獲得批準(zhǔn),要么正在進(jìn)行臨床開(kāi)發(fā)。
進(jìn)一步篩選發(fā)現(xiàn),其中有29種藥物顯示出對(duì)延緩大腦衰老有潛在作用。
這29種藥物中,包括達(dá)沙替尼、雙氯芬酸、地丹諾辛在內(nèi)的20種藥物的抗衰潛力已被前人研究所提及。
目前,針對(duì)這20種藥物中的13種(包括膽鈣化醇、達(dá)沙替尼、雙氯芬酸等),研究人員已經(jīng)在抗衰老臨床試驗(yàn)中進(jìn)行了測(cè)試或正在測(cè)試。
不過(guò)需要提醒,由于多數(shù)研究參與者來(lái)自歐洲,所以并不清楚這些發(fā)現(xiàn)是否適用于更多基因多樣性的人群。