人工智能如何助力惡性腦瘤的發(fā)展預(yù)測(cè)
譯文【51CTO.com快譯】隨著人工智能的發(fā)展, 與人們?nèi)粘I钕⑾⑾嚓P(guān)的許多領(lǐng)域都受到人工智能的影響。其中,醫(yī)療領(lǐng)域作為人們關(guān)注的重點(diǎn),很早便引入了機(jī)器學(xué)習(xí)來輔助醫(yī)生進(jìn)行治療。
例如人們可以利用機(jī)器學(xué)習(xí)來自動(dòng)識(shí)別 X 光片中的影像是否有骨折,或者判斷醫(yī)療影像中是否存在腫瘤或者癌癥。這些相關(guān)的研究有的歷史非常悠久,有長達(dá)10年甚至更久的研究時(shí)間。人工智能在醫(yī)療行業(yè)的商業(yè)化落地實(shí)踐,最近受到了風(fēng)投行業(yè)的追捧,成為了最為熱門的投資領(lǐng)域之一。
圖1. 人工智能醫(yī)療公司圖譜
MICCAI 是醫(yī)學(xué)圖像處理領(lǐng)域的權(quán)威會(huì)議。2016 年, Han Zhang 等3位研究者在 MICCAI 上發(fā)表了題為 Outcome Prediction for Patient with High-Grade Gliomas from Brain Functional and Structural Networks 的論文,講述了他們?nèi)绾卫脠D像處理和機(jī)器學(xué)習(xí)的技術(shù)預(yù)測(cè)腦瘤發(fā)展趨勢(shì)。下面我們來看一下他們的方法:
45% 的腦瘤都可以歸類為大腦膠質(zhì)瘤,論文是對(duì)高惡性程度大腦膠質(zhì)瘤(HGG)發(fā)展趨勢(shì)的預(yù)測(cè)。作者聲稱本研究是研究界首次通過分析大腦神經(jīng)連接情況進(jìn)行腦瘤預(yù)測(cè)。HGG 發(fā)展預(yù)測(cè)由3個(gè)部分組成:圖像處理、特征選擇、分類,具體步驟見下圖:
圖2. 腦瘤預(yù)測(cè)系統(tǒng)架構(gòu)圖
訓(xùn)練數(shù)據(jù)
作者選取了68名病人作為研究對(duì)象,其中34 名病人在 650 天內(nèi)病故,被當(dāng)作負(fù)樣本(bad)。另外 34 名病人存活日期超過了 650 天,被當(dāng)作正樣本(good)。訓(xùn)練數(shù)據(jù)來源為 rs-fMRI 數(shù)據(jù)和 DTI 數(shù)據(jù)。
圖像處理
作者利用了 SPM8 和DPARSF 軟件處理 rs-fMRI 數(shù)據(jù)來構(gòu)建功能性大腦網(wǎng)絡(luò)模型,同時(shí)采用 FSL 和 PANDA 軟件處理 DTI 數(shù)據(jù)來結(jié)構(gòu)性大腦網(wǎng)絡(luò)模型。
網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
針對(duì)結(jié)構(gòu)性大腦網(wǎng)絡(luò),作者利用 AAL 將大腦分割成 116 個(gè)區(qū)域,并構(gòu)建圖論模型。其中每個(gè)區(qū)域是圖中的一個(gè)結(jié)點(diǎn),有神經(jīng)纖維連接的區(qū)域之間產(chǎn)生一條邊,邊的權(quán)重與纖維的數(shù)量成正比,與兩個(gè)區(qū)域的皮質(zhì)表面積之和成反比。作者對(duì)這 116 個(gè)區(qū)域中的每個(gè)區(qū)域抽取了 BOLD 時(shí)間序列,并計(jì)算序列和序列之間的相關(guān)性作為節(jié)點(diǎn)之間的權(quán)重。
特征抽取
作者計(jì)算了構(gòu)建的大腦網(wǎng)絡(luò)中的如下特征作為機(jī)器學(xué)習(xí)模型的輸入數(shù)據(jù):網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)的度、 網(wǎng)絡(luò)的聚類系數(shù)和最短路徑長度、網(wǎng)絡(luò)效度和網(wǎng)絡(luò)中心度。還加入了13個(gè)額外特征,包括性別、年齡、腫瘤大小等。每個(gè)病人的特征總數(shù)為 2797 個(gè)。因?yàn)樘卣鞯木S數(shù)較高,會(huì)產(chǎn)生過擬合問題,作者采用如下3個(gè)步驟進(jìn)行特征抽?。?/p>
1. 利用 t-檢驗(yàn) 挑選出最能區(qū)分正負(fù)樣例的特征
2. 利用 RELIEF 算法給剩余的特征進(jìn)行排序并賦予權(quán)重
3. 使用序列后向法進(jìn)行特征選取。然后利用 SVM 在特征子集上進(jìn)行預(yù)測(cè)。準(zhǔn)確度最高的特征子集被用來作為分類步驟的特征。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
當(dāng)值采用臨床特征進(jìn)行預(yù)測(cè)時(shí),正確率只有 63.2%;當(dāng)采用全部特征進(jìn)行預(yù)測(cè)時(shí),正確率為 75%。具體實(shí)驗(yàn)結(jié)果參見下表:
圖3. 不同人工智能算法在腦瘤預(yù)測(cè)問題上的效果
人工智能醫(yī)療領(lǐng)域方興未艾,目前風(fēng)頭正勁。人工智能醫(yī)療涉及到圖像處理,機(jī)器學(xué)習(xí)等相關(guān)技術(shù),歷史淵源流長。近年來備受風(fēng)投青睞的人工智能醫(yī)療究竟是新瓶裝舊酒,還是下一個(gè)風(fēng)口,讓我們拭目以待。
原文標(biāo)題:Outcome Prediction for Patient with High-Grade Gliomas from Brain Functional and Structural Networks,作者:Luyan Liu,Han Zhang,Islem Rekik,Xiaobo Chen,Qian Wang,Dinggang Shen
汪昊,恒昌利通大數(shù)據(jù)部負(fù)責(zé)人,美國猶他大學(xué)碩士,在百度,新浪,網(wǎng)易,豆瓣等公司有多年的研發(fā)和技術(shù)管理經(jīng)驗(yàn),擅長機(jī)器學(xué)習(xí),大數(shù)據(jù),推薦系統(tǒng),社交網(wǎng)絡(luò)分析,計(jì)算機(jī)圖形學(xué),可視化等技術(shù)。在 TVCG 和 ASONAM 等國際會(huì)議和期刊發(fā)表論文 5 篇。本科畢業(yè)論文獲國際會(huì)議 IEEE SMI 2008 最佳論文獎(jiǎng)。
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