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一塊GPU模擬猴子大腦,普通臺式機(jī)變超算,英國大學(xué)研究登上Nature子刊

新聞 前端
你買來打游戲、「煉丹」的 Titan RTX,還能用來模擬猴子大腦。

 用計算機(jī)模擬動物大腦通常需要一臺強(qiáng)大、昂貴的超級計算機(jī),但最近的一項(xiàng)嘗試表明,安裝了高性能 GPU 的臺式機(jī)也能完成這項(xiàng)工作,而且模擬速度比超級計算機(jī)還快。

這項(xiàng)研究來自英國薩塞克斯大學(xué)(University of Sussex),研究者利用一臺搭載了 NVIDIA Titan RTX GPU 的臺式 PC 模擬了猴子大腦視覺皮層的一個大型模型。這個模型包含 4.13 × 10^6 個神經(jīng)元和 24.2 × 10^9 個突觸。實(shí)驗(yàn)所用的 GPU 內(nèi)存是 24GB,價值 2452 英鎊(約合 21780 元)。借助研究者提出的新方法,他們用單個 GPU 進(jìn)行的模擬比超級計算機(jī)速度還快,而且價格要便宜得多。

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長期以來,人們一直利用 GPU 來加速 AI 模型的計算,但在一個普通顯卡上運(yùn)行如此之大的模型還是第一次。

通常來說,這種級別的大腦模擬需要超級計算機(jī)來提供強(qiáng)大的內(nèi)存,但薩塞克斯大學(xué)的研究者提出了一種更加高效的技術(shù),可以大幅降低模擬過程中所需存儲的數(shù)據(jù)量。他們的方法被稱為「程序性連接(procedural connectivity)」,相關(guān)研究發(fā)表在 Nature 新子刊——《Nature Computational Science》上。這份子刊于 2021 年 1 月啟動,主要發(fā)表與計算技術(shù)和數(shù)學(xué)模型開發(fā)及使用相關(guān)的研究,以及它們在一系列科學(xué)學(xué)科(包括但不限于生物信息學(xué)、化學(xué)信息學(xué)、地理信息學(xué)、計算物理學(xué)和宇宙學(xué)、材料科學(xué)和城市科學(xué))領(lǐng)域的應(yīng)用。

論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s43588-020-00022-7?utm_medium

什么是「程序性連接」?

模擬大腦通常需要一個脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),這是一種特殊的 AI 系統(tǒng),可以模擬大腦的行為,神經(jīng)元通過一系列脈沖信號進(jìn)行通信。

為了準(zhǔn)確地預(yù)測脈沖如何影響神經(jīng)元,描述「哪些神經(jīng)元通過突觸連接在一起、如何連接」的信息通常在運(yùn)行模擬之前生成和存儲。然而,由于神經(jīng)元只是周期性地產(chǎn)生脈沖,將如此大量的數(shù)據(jù)持續(xù)保存在內(nèi)存中是非常低效的。

為了解決這一問題,研究者提出了「程序性連接」的概念。「程序性連接」可以讓研究者根據(jù)需要實(shí)時生成與神經(jīng)元連接相關(guān)的數(shù)據(jù),而不是在內(nèi)存中存儲數(shù)據(jù)并從中檢索信息。這完全消除了在內(nèi)存中存儲連接數(shù)據(jù)的必要性。

「這些實(shí)驗(yàn)通常需要你提前生成所有連接數(shù)據(jù),并用這些數(shù)據(jù)來填滿內(nèi)存,而我們的方法就是要避免這一過程?!拐撐淖髡?James Knight 表示。

他還補(bǔ)充說,「使用我們的方法,每次神經(jīng)元發(fā)出脈沖時,連接的細(xì)節(jié)就會重新生成?!埂肝覀兝?GPU 的能力,在每次脈沖發(fā)出時重新實(shí)時計算連接?!?/p>

也就是說,借助 GPU 的強(qiáng)大計算能力,當(dāng)神經(jīng)元脈沖被激發(fā)時,脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可以「程序性」地生成連接數(shù)據(jù)。

這一方法建立美國學(xué)者 Eugene Izhikevich 在 2006 年提出的研究基礎(chǔ)上,但彼時的計算機(jī)速度太慢,還不足以讓方法推廣應(yīng)用?,F(xiàn)在,GPU 的算力是 15 年前的 2000 倍,對于「脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)」來說,研究時機(jī)已經(jīng)成熟。

一臺電腦 + 一塊 GPU,或許就能復(fù)現(xiàn)大腦模擬論文

事實(shí)上,這項(xiàng)研究的結(jié)果不僅能夠與當(dāng)前最快的超級計算機(jī)相媲美,甚至還更快。在靜息態(tài)下,新方法模擬生物體的一秒只需要 8.4 分鐘,比之前的超級計算機(jī)模擬節(jié)省了多達(dá) 35% 的時間(一個例子就是 2018 年在 IBM Blue Gene/Q 上運(yùn)行的模擬)。

如同 Knight 介紹的那樣,這是因?yàn)?IBM 的設(shè)備是由 1000 個連接在一個房間里的計算節(jié)點(diǎn)組成的?!笩o論系統(tǒng)多么復(fù)雜,節(jié)點(diǎn)之間仍然存在一些延遲。模型隔得越遠(yuǎn),它就會越慢,而我們的模型速度可以快很多個量級?!?/p>

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James Knight 和 Thomas Nowotny。

除了提高實(shí)驗(yàn)速度之外,研究者還希望通過這種方法降低此類大型生物模擬研究的硬件門檻。在大腦模擬的研究領(lǐng)域,模型大小很可能以萬億字節(jié)計,但超級計算機(jī)只是少數(shù)研究團(tuán)隊(duì)的特權(quán)。

還有一點(diǎn)意義是:Knight 及其團(tuán)隊(duì)的研究可以讓神經(jīng)科學(xué)和人工智能研究者在他們的本地工作站上模擬大腦回路,同時也可以讓學(xué)術(shù)界以外的人把他們的游戲本變?yōu)橐慌_可以運(yùn)行大型神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的計算機(jī)。

Knight 表示:「 Nature Computational Science 的審稿人在自己的計算機(jī)上試驗(yàn)了這項(xiàng)研究?!挂虼?,如果你有一臺電腦和合適的 GPU,或許也可以查看論文中關(guān)于復(fù)現(xiàn)的說明部分,并上手一試。

程序性連接非常適合用于大腦模擬實(shí)驗(yàn)的脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),但 Knight 認(rèn)為,隨著類腦機(jī)器學(xué)習(xí)取得更多進(jìn)展,更多的人工智能應(yīng)用也將出現(xiàn)。

研究團(tuán)隊(duì)希望這種辦法能夠助力于科學(xué)研究,從而大大降低研究哺乳動物大腦工作方式和研究神經(jīng)系統(tǒng)疾病的成本。大腦模擬也是助力阿爾茨海默氏癥和帕金森氏癥的關(guān)鍵工具。

無論是繪制哺乳動物大腦的行為圖,還是開發(fā)更好的語音識別工具,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)正在受到學(xué)界和業(yè)界更多的關(guān)注?,F(xiàn)在,只要有一塊 GPU,誰又能說臥室不可以是夢開始的地方呢?

 

責(zé)任編輯:張燕妮 來源: 機(jī)器之心
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