「電子果蠅」驚動馬斯克!背后是13萬神經(jīng)元全腦圖譜,可在電腦上運行
腦科學(xué)研究又進一大步!
來自普林斯頓的科學(xué)家最新宣布,他們已經(jīng)成功創(chuàng)建了首個成年體動物的全腦連接體圖譜。
其中包含來自雌性黑腹果蠅大腦的130000個帶注釋的神經(jīng)元,以及它們之間的數(shù)千萬個化學(xué)突觸。
更重要的是,數(shù)據(jù)是完全開放的,還能一鍵查詢。
只需要在Codex這個網(wǎng)站上輸入相關(guān)信息,每個神經(jīng)元的連接性、大小、神經(jīng)遞質(zhì)等信息都能盡收眼底。
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包括直觀的3D模型。
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這項研究一經(jīng)發(fā)布,就吸引到大量關(guān)注。
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英偉達AI科學(xué)家范麟熙(Jim Fan)就轉(zhuǎn)發(fā)點贊:
令人著迷的是,普林斯頓大學(xué)的這項研究中,蘊含著大自然的注意力、工作記憶甚至基本意識算法。
將神經(jīng)連接體視作已編譯的可執(zhí)行二進制文件,我們可以從完整的大腦模擬中反編譯出多少源代碼?
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不僅如此,果蠅的大腦結(jié)構(gòu)還對機器學(xué)習(xí)有著重要啟發(fā)。
已經(jīng)有人在電腦上跑了一下這個模型,模擬了果蠅吃東西和梳理觸角的過程。
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馬斯克也關(guān)注到了這只“電子果蠅”,并感覺事情開始變得奇怪起來了。
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通過電鏡圖像繪制
研究團隊重建了雌性黑腹果蠅大腦完整連接體圖譜。
不同于傳統(tǒng)的切片方式,圖譜中的信息主要是從電鏡照片中獲得的。
這些電鏡照片來自Zheng和Lauritzen等人于2018年發(fā)布的FAFB(full adult fly brain)數(shù)據(jù)集。
電鏡照片的分辨率可以清晰地看到蛋白質(zhì)分子,經(jīng)過計算機分析就能得出有關(guān)信息。
尺寸僅為0.1毫米量級的果蠅大腦擁有上億個突觸,比哺乳動物的突觸還要密集。
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果蠅大腦中的神經(jīng)被分成9個大類、31個小類,劃分了78個區(qū)域。
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這九個大類是在將神經(jīng)元按照信息流向分為三個部分的基礎(chǔ)上繼續(xù)劃分得到的。
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通過與光學(xué)顯微鏡下的神經(jīng)結(jié)構(gòu)進行對比,團隊建立的模型準(zhǔn)確性得到了初步驗證。
進一步地,數(shù)值計算和人工抽樣檢查結(jié)果也證明了模型是準(zhǔn)確的。
此外,通過統(tǒng)計學(xué)分析,團隊還對神經(jīng)元之間的神經(jīng)遞質(zhì)成分進行了預(yù)測,且準(zhǔn)確率很高。
研究團隊還分析了果蠅眼部的神經(jīng)回路,追蹤了信息流從輸入神經(jīng)元到輸出神經(jīng)元傳遞的過程。
盡管輸入和輸出神經(jīng)元的數(shù)量在神經(jīng)系統(tǒng)中占據(jù)的比重很小,但它們是溝通大腦和外界的橋梁。
在這一過程中,團隊使用了一種概率模型,分析從種子神經(jīng)元開始的信息流。
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團隊針對每一個種子神經(jīng)元進行了遍歷,測量了信息傳到神經(jīng)中樞再到傳出神經(jīng)的過程。
遍歷過程中信息傳遞所經(jīng)過的距離被排序,然后進行歸一化處理。
這一過程幫助研究人員確定了不同類型的傳入信息是如何向相對應(yīng)的神經(jīng)中樞傳遞的,結(jié)果與預(yù)期相吻合。
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花費4年時間打造
值得一提的是,從成年果蠅完整大腦數(shù)據(jù)(FAFB)到完整構(gòu)建出成年果蠅的大腦圖譜,研究人員一共花費了194周,也就是4年左右的時間。
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而在此背后,這個名為FlyWire的項目得到了超過200名社區(qū)成員的貢獻支持。
官網(wǎng)信息顯示,F(xiàn)lyWire是一個人類-AI協(xié)作項目,旨在重建果蠅的全腦連接體。具體而言,F(xiàn)lyWire由普林斯頓大學(xué)的Mala Murthy和Sebastian Seung實驗室創(chuàng)建,社區(qū)由神經(jīng)生物學(xué)家、計算機科學(xué)家和校對人員組成。
通過將神經(jīng)元連接和大腦功能聯(lián)系起來,我們可以在理解大腦如何工作這件事上取得重大進展。
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論文地址:
[1]https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.27.546656v1.full.pdf[2]https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.27.546055v1.full.pdf[3]https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.05.02.539144v1.full.pdf